aidsВИЧ-инфекция и иммуносупрессииHIV Infection and Immunosuppressive Disorders2077-9828Baltic Medical Education Center10.22328/2077-9828-2017-9-1-82-92aids-242Research ArticleЭПИДЕМИОЛОГИЯEPIDEMIOLOGYМОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ И ФАРМАКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ ВИЧ-1 У ПАЦИЕНТОВ С НЕЭФФЕКТИВНОСТЬЮ АРВТ В ВЕЛИКОМ НОВГОРОДЕHIV-1 DRUG-RESISTANCE AND MOLECULAR EPIDEMIOLOGY IN PATIENTS WITH ART FAILURE IN VELIKY NOVGORODЧуринаМ. А.ChurinaM. A.

Чурина Мария Александровна — врач КЛД отделения диагностики ВИЧ-инфекции и СПИД-ассоциированных заболеваний, младший научный сотрудник лаборатории иммунологии и вирусологии ВИЧ-инфекции СПббНИИ ЭМ имени Пастера.

197101, ул. Мира, 14, Санкт-Петербург, Россия, e-mail: churina.mari@yandex.ru

churina.mari@yandex.ruОстанковаЮ. В.OstankovaYu. V.

Останкова Юлия Владимировна — научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии СПббНИИ ЭМ имени Пастера.

197101, ул. Мира, 14, Санкт-Петербург, +7 (812) 233-20-92, e-mail: shenna1@yandex.ru

shenna1@yandex.ruСеменовА. В.SemenovA. V.

Семенов Александр Владимирович — кандидат биологических наук, зав. лабораторией вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции СПббНИИ ЭМ имени Пастера; доцент кафедры иммунологии Первый СПбГМУ имени академика И.П.Павлова; доцент кафедры клинической лабораторной диагностики С-ЗГМУ имени И.И.Мечникова.

197101, ул. Мира, 14, Санкт-Петербург, Россия, +7 (812) 233-20-92, e-mail: alexvsemenov@yahoo.com

alexvsemenov@yahoo.comНикитинаН. А.NikitinaN. A.blednyh2012@mail.ruРосоловскийА. П.RosolovskyA. P.

Росоловский Анатолий Павлович — кандидат медицинских наук, руководитель Управления

+7 (8162) 97-11-06, e-mail: info@53.rospotrebnadzor.ru

Saint-Petersburg

info@53.rospotrebnadzor.ruГребенкинаЕ. В.GrebyonkinaE. V.

Гребенкина Екатерина Владимировна — главный специалист-эксперт.

(8162) 97-10-96, e-mail: info@53.rospotrebnadzor.ru

Saint-Petersburg

info@53.rospotrebnadzor.ruТкаченкоТ. Н.TkachenkoT. N.

Ткаченко Татьяна Николаевна — кандидат медицинских наук, врач-инфекционист, заместитель главного врача по медицинской части.

+7 (8162) 63-05-95, e-mail: helper_org@mail.ru

Saint-Petersburg

helper_org@mail.ruЖандармоваТ. А.ZhandarmovaT. А.

Жандармова Татьяна Александровна — врач-эпидемиолог.

Saint-Petersburg

helper_org@mail.ruТрофимоваТ. С.TrofimovaT. S.

Трофимова Татьяна Сергеевна — врач-инфекционист, зав. лечебно-консультативным отделом.

Saint-Petersburg

helper_org@mail.ruАсадуллаевМ. Р.AsadullayevM. R.

Асадуллаев Магомед Рабаданович — главный врач, заслуженный врач РФ.

+7 (8162) 63-05-95, e-mail: helper_org@mail.ru

Saint-Petersburg

helper_org@mail.ruБеляковН. А.BelyakovN. A.

Беляков Николай  Алексеевич — академик РАН, зав. кафедрой социально-значимых инфекций Первый СПбГМУ имени академика И.П.Павлова; главный научный сотрудник ИЭМФ СЗО РАМН; руководитель Северо-Западного окружного центра по профилактике и борьбе со СПИДом СПббНИИ ЭМ имени Пастера.

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14, e-mail: beliakov.akad.spb@yandex.ru

beliakov.akad.spb@yandex.ruТотолянА. А.TotolianA. A.

Тотолян Арег Артемович — академик РАН, директор СПббНИИ ЭМ имени Пастера; заведующий лабораторией молекулярной иммунологии, заведующий кафедрой иммунологии Первый СПбГМУ имени академика И.П.Павлова.

+7 (812) 232-00-66, e-mail: totolian@pasteurorg.ru

totolian@pasteurorg.ruСанкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени ПастераРоссияSaint-Petersburg Pasteur InstituteRussian FederationСанкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П.Павлова; Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И.МечниковаРоссияSaint-Petersburg Pasteur Institute; I.P. Pavlov SPbMU MON; North-West State Medical University named after I.I.MechnikovRussian FederationУправление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Новгородской областиРоссияFederal Service on customers’ Rights Protection and Human Well-being surveillance in the Novgorod regionRussian FederationХелпер, Новгородский центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниямиРоссияHelper, Novgorod Center for Prevention and Control of AIDS and Infectious DiseasesRussian FederationХелпер, Новгородский центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниямиРоссияFederal Service on customers’ Rights Protection and Human Well-being surveillance in the Novgorod regionRussian FederationСанкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П.ПавловаРоссияSaint-Petersburg Pasteur Institute; I.P. Pavlov SPbMU MONRussian Federation201703042017918292Copyright © Чурина М.А., Останкова Ю.В., Семенов А.В., Никитина Н.А., Росоловский А.П., Гребенкина Е.В., Ткаченко Т.Н., Жандармова Т.А., Трофимова Т.С., Асадуллаев М.Р., Беляков Н.А., Тотолян А.А., 20172017Чурина М.А., Останкова Ю.В., Семенов А.В., Никитина Н.А., Росоловский А.П., Гребенкина Е.В., Ткаченко Т.Н., Жандармова Т.А., Трофимова Т.С., Асадуллаев М.Р., Беляков Н.А., Тотолян А.А.Churina M.A., Ostankova Y.V., Semenov A.V., Nikitina N.A., Rosolovsky A.P., Grebyonkina E.V., Tkachenko T.N., Zhandarmova T.А., Trofimova T.S., Asadullayev M.R., Belyakov N.A., Totolian A.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/242

Целью нашей работы было оценить молекулярно-эпидемиологическую структуру и фармакорезистентные варианты вируса иммунодефицита человека типа 1 у пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Великом Новгороде.

Материалы и методы

Материалы и методы. В работе были использованы образцы плазмы крови 25 пациентов с инфекцией вируса иммунодефицита человека из Великого Новгорода, направленные на определение лекарственной устойчивости вирусом в связи с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии. Определение субтипов вируса иммунодефицита человека типа 1 проводили на основе анализа нуклеотидных последовательностей участка гена полимеразы (pol) протяженностью 1285 нт., кодирующего ген протеазы (PR) протяженностью 465 нт. и участок гена обратной транскриптазы (RT) протяженностью 820 нт.

Результаты

Результаты. Согласно филогенетическому анализу изолятов, в обследованной группе больных преобладал вирус иммунодефицита человека типа 1 субтип A1 (96%), являющийся наиболее распространенным вариантом этого вируса в России, и только один образец относился к рекомбинантной форме CRF_03  AB (4%). У 66,7%  мужчин и у 60% женщин инфекция впервые была выявлена в возрасте старше 30 лет, что отражает особенность эпидемии последних лет в РФ. При оценке мутаций лекарственной устойчивости только у 56% пациентов определены мутации резистентности к каким-либо препаратам. Из них мутации устойчивости к нуклеозидным ингибиторам обратной транскриптазы составили 85,7%  (48%  от числа исследуемых общей группы), мутации устойчивости к ненуклеозидным ингибиторам обратной транскриптазы — 78,57% (44%  соответственно), мутации устойчивости к ингибиторам протеазы — 21,42% (12% соответственно). Проведенный молекулярно-генетический анализ подтверждает высокую гомогенность вируса на территории РФ, однако выявленная кластеризация свидетельствует о множественных независимых эпизодах проникновения вируса в популяцию потребителей инъекционных наркотиков в Новгородской области. 

The aim of study was to evaluate the molecular structure of the epidemiological and drug-resistant HIV-1 variants in patients with ART failure in Veliky Novgorod. Patients’ blood plasma (n=25) with HIV infection from Veliky Novgorod were used, aimed at identifying drug resistant viruses due to ART failure. Determination of subtypes of HIV-1 was performed by nucleotide sequence analysis of polymerase gene (pol) length of 1285 nt, protease encoding (PR) 465 nt in length and the reverse transcriptase (RT) gene portion length of 820 nt. Isolates phylogenetic analysis indicates that the predominant HIV-1 subtype A1 (96%) in the studied group of patients, which is the most common form of HIV-1 in Russia, and only one sample is a recombinant form of CRF_03 AB (4%).  In 66,7% of men and 60% of women with HIV infection was first detected at the age of 30, which reflects the characteristics of the epidemic in recent years in the Russian Federation. When evaluating drug resistance mutations in only 56% of patients mutations of resistance  to any drugs were identified. Nucleoside reverse transcriptase inhibitors resistance  mutations  were detected in 85,7% (48% of the group in total), non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors resistance mutations were detected in 78,57% (44% of the group in total), protease inhibitors resistance mutations were detected in 21,42% (12% of the group). Molecular genetic analysis confirms the high virus homogeneity on the territory of the Russian Federation, however, reveals evidence of clustering multiple independent episodes of the virus penetration in the injecting drug users population in Novgorod region.

ВИЧмолекулярная эпидемиологияген polпротеазаобратная транскриптазасубтипантиретровирусная терапиярезистентностьHIVmolecular epidemiologygene polproteasereverse transcriptasesubtypeReferencesJoint United Nations Programme on HIV/AIDS., United Nations. Global Report: UNAIDS Report on the Global AIDS epidemic: 2012. Geneva: UNAIDS, 2012, pp. 103, A5.Joint United Nations Programme on HIV/AIDS., United Nations. Global Report: UNAIDS Report on the Global AIDS epidemic: 2012. Geneva: UNAIDS, 2012, pp. 103, A5.Москвичева М.Г., Радзиховская М.В. Анализ мирового опыта противодействия эпидемии ВИЧ/СПИДА // Уральский медицинский журнал. 2016. № 4. С. 132–137. [Moskvicheva M.G., Radzikhovskaya M.V., Analysis of world experience of HIV/AIDS. Uraljskiyj Medicinskiyj Journal, 2016, No. 4, pp. 132–137 (In Russ.)].Москвичева М.Г., Радзиховская М.В. Анализ мирового опыта противодействия эпидемии ВИЧ/СПИДА // Уральский медицинский журнал. 2016. № 4. С. 132–137. [Moskvicheva M.G., Radzikhovskaya M.V., Analysis of world experience of HIV/AIDS. Uraljskiyj Medicinskiyj Journal, 2016, No. 4, pp. 132–137 (In Russ.)].Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек, 2014. 288 с. [Bobkova M.R. Drug resistance of HIV. Moscow: Chelovek, 2014, 288 p. (In Russ.)].Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек, 2014. 288 с. [Bobkova M.R. Drug resistance of HIV. Moscow: Chelovek, 2014, 288 p. (In Russ.)].Korber B., Muldoon M., Theiler J., Gao F., Gupta R., Lapedes A., Hahn B.H., Wolinsky S., Bhattacharya T. Timing the ancestor of the HIV-1 pandemic strains. Science, 2000, Vol. 288 (5472), рр. 1789–1796.Korber B., Muldoon M., Theiler J., Gao F., Gupta R., Lapedes A., Hahn B.H., Wolinsky S., Bhattacharya T. Timing the ancestor of the HIV-1 pandemic strains. Science, 2000, Vol. 288 (5472), рр. 1789–1796.Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. Global and regional distribution of HIV-1 genetic subtypes and recombinants in 2004. AIDS, 2006, Vol. 20 (16), рр. 13–23.Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. Global and regional distribution of HIV-1 genetic subtypes and recombinants in 2004. AIDS, 2006, Vol. 20 (16), рр. 13–23.Kiwanuka N., Laeyendecker O., Robb M., Kigozi G., Arroyo M., McCutchan F. et al. Effect of human immunodeficiency virus Type 1 (HIV-1) subtype on disease progression in persons from Rakai, Uganda, with incident HIV-1 infection. J. Infect. Dis., 2008, Vol. 197, pp. 707–713.Kiwanuka N., Laeyendecker O., Robb M., Kigozi G., Arroyo M., McCutchan F. et al. Effect of human immunodeficiency virus Type 1 (HIV-1) subtype on disease progression in persons from Rakai, Uganda, with incident HIV-1 infection. J. Infect. Dis., 2008, Vol. 197, pp. 707–713.Baeten J.M., Chohan B., Lavreys L., Chohan V., McClelland R.S., Certain L. HIV-1 subtype D infection is associated with faster disease progression than subtype A in spite of similar plasma HIV-1 loads. J. Infect Dis., 2007, Vol. 195, рр. 1177–1180.Baeten J.M., Chohan B., Lavreys L., Chohan V., McClelland R.S., Certain L. HIV-1 subtype D infection is associated with faster disease progression than subtype A in spite of similar plasma HIV-1 loads. J. Infect Dis., 2007, Vol. 195, рр. 1177–1180.Kiwanuka N., Laeyendecker O., Quinn T.C., Wawer M.J., Shepherd J., Robb M. HIV-1 subtypes and differences in heterosexual HIV transmission among HIV-discordant couples in Rakai, Uganda. AIDS, 2009, Vol. 23, рр. 2479–2484.Kiwanuka N., Laeyendecker O., Quinn T.C., Wawer M.J., Shepherd J., Robb M. HIV-1 subtypes and differences in heterosexual HIV transmission among HIV-discordant couples in Rakai, Uganda. AIDS, 2009, Vol. 23, рр. 2479–2484.Renjifo B., Gilbert P., Chaplin B., Msamanga G., Mwakagile D., Fawzi W. Preferential in-utero transmission of HIV-1 subtype C as compared to HIV-1 subtype A or D. AIDS, 2004, Vol. 18, рр. 1629–1636.Renjifo B., Gilbert P., Chaplin B., Msamanga G., Mwakagile D., Fawzi W. Preferential in-utero transmission of HIV-1 subtype C as compared to HIV-1 subtype A or D. AIDS, 2004, Vol. 18, рр. 1629–1636.Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. 2006. Global trends in molecular epidemiology of HIV-1 during 2000–2007. AIDS, 2011, Vol. 25 (5), рр. 679–689.Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. 2006. Global trends in molecular epidemiology of HIV-1 during 2000–2007. AIDS, 2011, Vol. 25 (5), рр. 679–689.Dineke Frentz, Annemarie M.J. Wensing, Jan Albert, Dimitrios Paraskevis, Ana B. Abecasis, Osamah Hamouda, Louise B. Jörgensen, Claudia Kücherer, Daniel Struck, Jean-Claude Schmit, Birgitta Åsjö, Claudia Balotta, Danail Beshkov, Ricardo J. Camacho, Bonaventura Clotet, Suzie Coughlan, Stéphane De Wit, Algirdas Griskevicius, Zehava Grossman, Andrzej Horban, Tatjana Kolupajeva, Klaus Korn, Leondios G. Kostrikis, Kirsi Liitsola, Marek Linka, Claus Nielsen, Dan Otelea, Roger Paredes, Mario Poljak, Elisabeth Puchhammer-Stöckl, Anders Sönnerborg, Danica Stanekova, Maja Stanojevic, Anne-Mieke Vandamme, Chales A.B. Boucher, David A.M.C. Van de Vijver. Limited cross-border infections in patients newly diagnosed with HIV in Europe. Retrovirology, 2013, Vol. 10, рр. 36.Dineke Frentz, Annemarie M.J. Wensing, Jan Albert, Dimitrios Paraskevis, Ana B. Abecasis, Osamah Hamouda, Louise B. Jörgensen, Claudia Kücherer, Daniel Struck, Jean-Claude Schmit, Birgitta Åsjö, Claudia Balotta, Danail Beshkov, Ricardo J. Camacho, Bonaventura Clotet, Suzie Coughlan, Stéphane De Wit, Algirdas Griskevicius, Zehava Grossman, Andrzej Horban, Tatjana Kolupajeva, Klaus Korn, Leondios G. Kostrikis, Kirsi Liitsola, Marek Linka, Claus Nielsen, Dan Otelea, Roger Paredes, Mario Poljak, Elisabeth Puchhammer-Stöckl, Anders Sönnerborg, Danica Stanekova, Maja Stanojevic, Anne-Mieke Vandamme, Chales A.B. Boucher, David A.M.C. Van de Vijver. Limited cross-border infections in patients newly diagnosed with HIV in Europe. Retrovirology, 2013, Vol. 10, рр. 36.Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Васильев А.В., Лага В.Ю., Грезина Л.А., Волова Л.Ю., Бобкова М.Р. Проблемы субтипирования ВИЧ-1 на основе анализа гена pol и способы их разрешения // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2010. Т. 2, № 3. С. 42–48. [Kazennova E.V., Lapovok I.A., Vasilyev A.V., Laga V.Yu., Grezina L.A., Volova L.Yu., Bobkova M.R. Problems of subtyping of HIV-1 on the base of pol gene and ways of their permission. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2010, Vol. 2, No. 3, pp. 42–48 (In Russ.)].Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Васильев А.В., Лага В.Ю., Грезина Л.А., Волова Л.Ю., Бобкова М.Р. Проблемы субтипирования ВИЧ-1 на основе анализа гена pol и способы их разрешения // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2010. Т. 2, № 3. С. 42–48. [Kazennova E.V., Lapovok I.A., Vasilyev A.V., Laga V.Yu., Grezina L.A., Volova L.Yu., Bobkova M.R. Problems of subtyping of HIV-1 on the base of pol gene and ways of their permission. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2010, Vol. 2, No. 3, pp. 42–48 (In Russ.)].Беляков Н.А., Розенталь В.В., Дементьева Н.Е., Виноградова Т.Н., Сизова Н.В. Моделирование и общие закономерности циркуляции субтипов и рекомбинантных форм ВИЧ // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 2. С. 7–18. [Belyakov N.A., Rozental V.V., Dementeva N.E., Vinogradova T.N., Sizova N.V. Mathematical modelling and general trends of circulation of HIV subtypes and recombinant forms. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 2, pp. 7–18 (In Russ.)].Беляков Н.А., Розенталь В.В., Дементьева Н.Е., Виноградова Т.Н., Сизова Н.В. Моделирование и общие закономерности циркуляции субтипов и рекомбинантных форм ВИЧ // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 2. С. 7–18. [Belyakov N.A., Rozental V.V., Dementeva N.E., Vinogradova T.N., Sizova N.V. Mathematical modelling and general trends of circulation of HIV subtypes and recombinant forms. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 2, pp. 7–18 (In Russ.)].Neogi U., Bontell I., Shet A., De Costa A., Gupta S., Diwan V., Laishram R.S., Wanchu A., Ranga U., Banerjea A.C., Sönnerborg A. Molecular Epidemiology of HIV-1 Subtypes in India: Origin and Evolutionary History of the Predominant Subtype C. PLoS One, 2012, Vol. 7 (6), рр. e39819.Neogi U., Bontell I., Shet A., De Costa A., Gupta S., Diwan V., Laishram R.S., Wanchu A., Ranga U., Banerjea A.C., Sönnerborg A. Molecular Epidemiology of HIV-1 Subtypes in India: Origin and Evolutionary History of the Predominant Subtype C. PLoS One, 2012, Vol. 7 (6), рр. e39819.Carr J.K., Torimiro J.N., Wolfe N.D., Eitel M.N., Kim B., Sanders-Buell E., Jagodzinski L.L., Gotte D., Burke D.S., Birx D.L., McCutchan F.E. The AG recombinant IbNG and novel strains of group M HIV-1 are common in Cameroon. Virology, 2001, Vol. 20, No. 286 (1), рр. 168–181.Carr J.K., Torimiro J.N., Wolfe N.D., Eitel M.N., Kim B., Sanders-Buell E., Jagodzinski L.L., Gotte D., Burke D.S., Birx D.L., McCutchan F.E. The AG recombinant IbNG and novel strains of group M HIV-1 are common in Cameroon. Virology, 2001, Vol. 20, No. 286 (1), рр. 168–181.Chan L.G., Ho M.J., Kaur P., Singh J., Ng O.T., Lee C.C., Leo Y.S., Carvalhal A. Differences in clinical and psychiatric outcomes between prevalent HIV-1 molecular subtypes in a multiethnic Southeast Asian sample. Gen. Hosp. Psychiatry, 2016, Vol. 38, рр. 4–8.Chan L.G., Ho M.J., Kaur P., Singh J., Ng O.T., Lee C.C., Leo Y.S., Carvalhal A. Differences in clinical and psychiatric outcomes between prevalent HIV-1 molecular subtypes in a multiethnic Southeast Asian sample. Gen. Hosp. Psychiatry, 2016, Vol. 38, рр. 4–8.Hughes G.J., Fearnhill E., Dunn D., Lycett S.J., Rambaut A., Leigh Brown A.J. Molecular Phylodynamics of the Heterosexual HIV Epidemic in the United Kingdom. PLoS Pathog., 2009, Vol. 5 (9), рр. e1000590.Hughes G.J., Fearnhill E., Dunn D., Lycett S.J., Rambaut A., Leigh Brown A.J. Molecular Phylodynamics of the Heterosexual HIV Epidemic in the United Kingdom. PLoS Pathog., 2009, Vol. 5 (9), рр. e1000590.Neogi U., Häggblom A., Santacatterina M., Bratt G., Gisslén M., Albert J., Sonnerborg A. Temporal Trends in the Swedish HIV-1 Epidemic: Increase in Non-B Subtypes and Recombinant Forms over Three Decades. PLoS One, 2014, Vol. 9 (6), рр. e99390.Neogi U., Häggblom A., Santacatterina M., Bratt G., Gisslén M., Albert J., Sonnerborg A. Temporal Trends in the Swedish HIV-1 Epidemic: Increase in Non-B Subtypes and Recombinant Forms over Three Decades. PLoS One, 2014, Vol. 9 (6), рр. e99390.Paraskevis D., Pybus O., Magiorkinis G., Hatzakis A., Wensing A.M., van de Vijver D.A., Albert J., Angarano G., Asjo B., Balotta C. Tracing the HIV-1 subtype B mobility in Europe: a phylogeographic approach. Retrovirology, 2009, Vol. 6, рр. 49.Paraskevis D., Pybus O., Magiorkinis G., Hatzakis A., Wensing A.M., van de Vijver D.A., Albert J., Angarano G., Asjo B., Balotta C. Tracing the HIV-1 subtype B mobility in Europe: a phylogeographic approach. Retrovirology, 2009, Vol. 6, рр. 49.Dukhovlinova E., Masharsky A., Toussova O., Verevochkin S., Solovyeva T., Meringof M., Paintsil E., White E., Barbour R., Heimer R., Kozlov A. Two Independent HIV Epidemics in St. Petersburg, Russia Revealed by Molecular Epidemiology. AIDS Res. Hum. Retrov., 2015, Vol. 31 (6), рр. 608–614.Dukhovlinova E., Masharsky A., Toussova O., Verevochkin S., Solovyeva T., Meringof M., Paintsil E., White E., Barbour R., Heimer R., Kozlov A. Two Independent HIV Epidemics in St. Petersburg, Russia Revealed by Molecular Epidemiology. AIDS Res. Hum. Retrov., 2015, Vol. 31 (6), рр. 608–614.Казеннова Е.В., Нешумаев Д.А., Руковицин Д.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Ракчеева О.В., Васильев А.В., Туманов А.С., Воронцова Г.А., Кузнецова А.В., Лойфман Е.А., Старухина И.Н., Кустова О.И., Половица Н.В., Липская Н.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологи ческий анализ эпидемии ВИЧ-инфекции в Благовещенске и Хабаровске (Дальний Восток России) // Вопросы вирусологии. 2014. № 4. С. 31–36. [Kazennova E.V., Neshumaev D.A., Rukovicin D.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Rakcheeva O.V., Vasiljev A.V., Tumanov A.S., Voroncova G.A., Kuznecova A.V., Loyjfman E.A., Starukhina I.N., Kustova O.I., Polovica N.V., Lipskaya N.A., Bobkova M.R. Questions of Virology. 2014, No. 4, pp. 31–36 (In Russ.)].Казеннова Е.В., Нешумаев Д.А., Руковицин Д.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Ракчеева О.В., Васильев А.В., Туманов А.С., Воронцова Г.А., Кузнецова А.В., Лойфман Е.А., Старухина И.Н., Кустова О.И., Половица Н.В., Липская Н.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологи ческий анализ эпидемии ВИЧ-инфекции в Благовещенске и Хабаровске (Дальний Восток России) // Вопросы вирусологии. 2014. № 4. С. 31–36. [Kazennova E.V., Neshumaev D.A., Rukovicin D.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Rakcheeva O.V., Vasiljev A.V., Tumanov A.S., Voroncova G.A., Kuznecova A.V., Loyjfman E.A., Starukhina I.N., Kustova O.I., Polovica N.V., Lipskaya N.A., Bobkova M.R. Questions of Virology. 2014, No. 4, pp. 31–36 (In Russ.)].Москалейчик Ф.Ф., Лага В.Ю., Дельгадо Е., Вега И., Фернандес-Гарсия А., Перес-Альварес Л., Корнилаева Г.В., Пронин А.Ю., Жернов Ю.В., Томсон М.М., Бобкова М.Р., Карамов Э.В. Стремительное распространение циркулирующей рекомбинантной формы CRF02-AG ВИЧ-1 на территории России и сопредельных стран // Вопросы вирусологии. 2015. Т. 60, № 6. С. 14–19. [Moskaleyjchik F.F., Laga V.Yu., Deljgado E., Vega I., Fernandes-Garsiya A., Peres-Aljvares L., Kornilaeva G.V., Pronin A.Yu., Zhernov Yu.V., Tomson M.M., Bobkova M.R., Karamov Eh.V. The rapid expansion of circulating recombinant form, CRF02-AG HIV-1 on the territory of Russia and adjacent countries. Questions of Virology, 2015, Vol. 60, No. 6, pp. 14–19 (In Russ.)].Москалейчик Ф.Ф., Лага В.Ю., Дельгадо Е., Вега И., Фернандес-Гарсия А., Перес-Альварес Л., Корнилаева Г.В., Пронин А.Ю., Жернов Ю.В., Томсон М.М., Бобкова М.Р., Карамов Э.В. Стремительное распространение циркулирующей рекомбинантной формы CRF02-AG ВИЧ-1 на территории России и сопредельных стран // Вопросы вирусологии. 2015. Т. 60, № 6. С. 14–19. [Moskaleyjchik F.F., Laga V.Yu., Deljgado E., Vega I., Fernandes-Garsiya A., Peres-Aljvares L., Kornilaeva G.V., Pronin A.Yu., Zhernov Yu.V., Tomson M.M., Bobkova M.R., Karamov Eh.V. The rapid expansion of circulating recombinant form, CRF02-AG HIV-1 on the territory of Russia and adjacent countries. Questions of Virology, 2015, Vol. 60, No. 6, pp. 14–19 (In Russ.)].Суханова А.Л., Казеннова Е.В., Рудинский Н.И., Михайлович В.М., Грядунов Д.А., Будилов А.В., Булавкина М.А., Weber J.N., Покровский В.В., Бобков А.Ф. Генетическая изменчивость области, кодирующей протеазу, у изолятов ВИЧ-1 подтипа А и рекомбинантов CRF03_AB на территории СНГ // Вопросы вирусологии. 2004. Т. 49, № 6. С. 4–10. [Sukhanova A.L., Kazennova E.V., Rudinskiyj N.I., Mikhayjlovich V.M., Gryadunov D.A., Budilov A.V., Bulavkina M.A., Weber J.N., Pokrovskiyj V.V., Bobkov A.F. Voprosih virusologii, 2004, Vol. 49, No. 6, pp. 4–10 (In Russ.)].Суханова А.Л., Казеннова Е.В., Рудинский Н.И., Михайлович В.М., Грядунов Д.А., Будилов А.В., Булавкина М.А., Weber J.N., Покровский В.В., Бобков А.Ф. Генетическая изменчивость области, кодирующей протеазу, у изолятов ВИЧ-1 подтипа А и рекомбинантов CRF03_AB на территории СНГ // Вопросы вирусологии. 2004. Т. 49, № 6. С. 4–10. [Sukhanova A.L., Kazennova E.V., Rudinskiyj N.I., Mikhayjlovich V.M., Gryadunov D.A., Budilov A.V., Bulavkina M.A., Weber J.N., Pokrovskiyj V.V., Bobkov A.F. Voprosih virusologii, 2004, Vol. 49, No. 6, pp. 4–10 (In Russ.)].Geretti A.M., Harrison L., Green H., Sabin C., Hill T., Fearnhill E. et al. Effect of HIV-1 subtype on virologic and immunologic response to starting highly active antiretroviral therapy. Clin. Infect. Dis., 2009, Vol. 48, рр. 1296–1305.Geretti A.M., Harrison L., Green H., Sabin C., Hill T., Fearnhill E. et al. Effect of HIV-1 subtype on virologic and immunologic response to starting highly active antiretroviral therapy. Clin. Infect. Dis., 2009, Vol. 48, рр. 1296–1305.Martinez-Cajas J.L., Pai N.P., Klein M.B., Wainberg M.A. Differences in resistance mutations among HIV-1 non-subtype B infections: a systematic review of evidence (1996–2008). J. Int. AIDS Soc., 2009, Vol. 12. рр. 11.Martinez-Cajas J.L., Pai N.P., Klein M.B., Wainberg M.A. Differences in resistance mutations among HIV-1 non-subtype B infections: a systematic review of evidence (1996–2008). J. Int. AIDS Soc., 2009, Vol. 12. рр. 11.Бобкова М.Р. История и некоторые результаты генотипирования ВИЧ в России // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. № 4. С. 7–16. [Bobkova M.R. History and some results of HIV genotyping in Russia. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2015, No. 4, pp. 7–16 (In Russ.)].Бобкова М.Р. История и некоторые результаты генотипирования ВИЧ в России // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. № 4. С. 7–16. [Bobkova M.R. History and some results of HIV genotyping in Russia. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2015, No. 4, pp. 7–16 (In Russ.)].Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol., 2011, Vol. 28 (10), рр. 2731–2739.Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol., 2011, Vol. 28 (10), рр. 2731–2739.Смольская Т.Т., Огурцова С.В. Обзор состояния эпидемии ВИЧ-инфекции в Северо-Западном федеральном округе РФ в 1987–2009 гг. // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. Т. 3, № 1. С. 27–36. [Smolskaya T.T., Ogurtsova S.V. Overview of the status of HIV epidemic in the North-West region of Russia in the years 1987–2009. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 1, pp. 27–36 (In Russ.)].Смольская Т.Т., Огурцова С.В. Обзор состояния эпидемии ВИЧ-инфекции в Северо-Западном федеральном округе РФ в 1987–2009 гг. // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. Т. 3, № 1. С. 27–36. [Smolskaya T.T., Ogurtsova S.V. Overview of the status of HIV epidemic in the North-West region of Russia in the years 1987–2009. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 1, pp. 27–36 (In Russ.)].Беляков Н.А., Семенов А.В., Коновалова Н.В., Огурцова С.В., Светличная Ю.С., Эсауленко Е.В., Асадуллаев М.Р., Амозов А.М., Белов С.В., Гусев Д.А., Карпунов А.А., Ковеленов А.Ю., Мельникова Т.Н., Поган С.С., Попова Е.С., Сивачева И.Л., Черкес Н.Н., Пантелеев А.М. ВИЧ-инфекция и коморбидные состояния в Северо-Западном федеральном округе Российской Федерации в 2015 году: аналитический обзор. СПб.: ФБУН «НИИЭМ имени Пастера», 2016. 48 с. [Belyakov N.A., Semenov A.V., Konovalova N.V., Ogurtsova S.V., Svetlichnaya Yu.S., Ehsaulenko E.V., Asadullaev M.R., Amozov A.M., Belov S.V., Gusev D.A., Karpunov A.A., Kovelenov A.Yu., Meljnikova T.N., Pogan S.S., Popova E.S., Sivacheva I.L., Cherkes N.N., Panteleev A.M. HIV infection and comorbid conditions in the North-West Federal district of the Russian Federation in 2015: an analytical review. Saint-Petersburg: Saint-Petersburg Pasteur Institute, 2016, 48 p. (In Russ.)].Беляков Н.А., Семенов А.В., Коновалова Н.В., Огурцова С.В., Светличная Ю.С., Эсауленко Е.В., Асадуллаев М.Р., Амозов А.М., Белов С.В., Гусев Д.А., Карпунов А.А., Ковеленов А.Ю., Мельникова Т.Н., Поган С.С., Попова Е.С., Сивачева И.Л., Черкес Н.Н., Пантелеев А.М. ВИЧ-инфекция и коморбидные состояния в Северо-Западном федеральном округе Российской Федерации в 2015 году: аналитический обзор. СПб.: ФБУН «НИИЭМ имени Пастера», 2016. 48 с. [Belyakov N.A., Semenov A.V., Konovalova N.V., Ogurtsova S.V., Svetlichnaya Yu.S., Ehsaulenko E.V., Asadullaev M.R., Amozov A.M., Belov S.V., Gusev D.A., Karpunov A.A., Kovelenov A.Yu., Meljnikova T.N., Pogan S.S., Popova E.S., Sivacheva I.L., Cherkes N.N., Panteleev A.M. HIV infection and comorbid conditions in the North-West Federal district of the Russian Federation in 2015: an analytical review. Saint-Petersburg: Saint-Petersburg Pasteur Institute, 2016, 48 p. (In Russ.)].Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. Т. 3, № 4. С. 34–44. [Dementjeva N.E., Sizova N.V., Lisicina Z.N., Maklakova V.A., Krutickaya L.I., Belyakov N.A. Analysis of HIV subtypes and dru-resistant variants circulating in Saint-Petersburg. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 4, pp. 34–44 (In Russ.)].Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. Т. 3, № 4. С. 34–44. [Dementjeva N.E., Sizova N.V., Lisicina Z.N., Maklakova V.A., Krutickaya L.I., Belyakov N.A. Analysis of HIV subtypes and dru-resistant variants circulating in Saint-Petersburg. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 4, pp. 34–44 (In Russ.)].Рахманова А.Г., Захарова Н.Г., Торопов С.Э., Степанова Е.В., Рассохин В.В. Формирование резистентности к высокоактивной антиретровирусной терапии у ВИЧ-инфицированных пациентов // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 2. С. 55–63. [Rakhmanova A.G., Zakharova N.G., Toropov S.Eh., Stepanova E.V., Rassokhin V.V. Development of HIV resistance to highly active antiretroviral therapy. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 2, pp. 55–63 (In Russ.)].Рахманова А.Г., Захарова Н.Г., Торопов С.Э., Степанова Е.В., Рассохин В.В. Формирование резистентности к высокоактивной антиретровирусной терапии у ВИЧ-инфицированных пациентов // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 2. С. 55–63. [Rakhmanova A.G., Zakharova N.G., Toropov S.Eh., Stepanova E.V., Rassokhin V.V. Development of HIV resistance to highly active antiretroviral therapy. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 2, pp. 55–63 (In Russ.)].Rumyantseva O.A., Olkhovskiy I.A., Malysheva M.A., Ruzaeva L.A., Vasiliev A.V., Kazennova E.V., Bobkova M.R., Lukashov V.V. Epidemiological networks and drug resistance of HIV type 1 in Krasnoyarsk region, Russia. AIDS Res. Hum. Retrov., 2009, Vol. 25 (9), рр. 931–936.Rumyantseva O.A., Olkhovskiy I.A., Malysheva M.A., Ruzaeva L.A., Vasiliev A.V., Kazennova E.V., Bobkova M.R., Lukashov V.V. Epidemiological networks and drug resistance of HIV type 1 in Krasnoyarsk region, Russia. AIDS Res. Hum. Retrov., 2009, Vol. 25 (9), рр. 931–936.Bobkov A., Kazennova E., Selimova L., Bobkova M., Khanina T., Ladnaya N., Kravchenko A., Pokrovsky V., Cheingsong-Popov R., Weber J. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: identification of subtype A, subtype B, and novel gagA/envB recombinants. AIDS Res. Hum. Retrov., 1998, Vol. 14, No. 8. рр. 669–676.Bobkov A., Kazennova E., Selimova L., Bobkova M., Khanina T., Ladnaya N., Kravchenko A., Pokrovsky V., Cheingsong-Popov R., Weber J. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: identification of subtype A, subtype B, and novel gagA/envB recombinants. AIDS Res. Hum. Retrov., 1998, Vol. 14, No. 8. рр. 669–676.Smolskaya T., Liitsola K., Zetterberg V., Golovanova E., Kevlova N., Konovalova N., Sevastianova K., Brummer-Korvenkontio H., Salminen M. HIV epidemiology in the Northwestern Federal District of Russia: Dominance of HIV type 1 subtype A. AIDS Res. Hum. Retrov., 2006, Vol. 22 (11), рр. 1074–1080.Smolskaya T., Liitsola K., Zetterberg V., Golovanova E., Kevlova N., Konovalova N., Sevastianova K., Brummer-Korvenkontio H., Salminen M. HIV epidemiology in the Northwestern Federal District of Russia: Dominance of HIV type 1 subtype A. AIDS Res. Hum. Retrov., 2006, Vol. 22 (11), рр. 1074–1080.Богачев В.В., Тотменин А.В., Барышев П.Б., Мещерякова Ю.В., Черноусова Н.Я., Гашникова Н.М. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1 субтипов А и В, выделенных на территории Новосибирской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии, иммунобиологии. 2012. № 6. С. 45–52. [Bogachev V.V., Totmenin A.V., Barihshev P.B., Metheryakova Yu.V., Chernousova N.Ya., Gashnikova N.M. Molecular genetic characterization of HIV-1 subtypes A and b allocated on the territory of Novosibirsk region. Journal of Microbiology, Еpidemiology and Immunobiology, 2012, No. 6, pp. 45–52 (In Russ.)].Богачев В.В., Тотменин А.В., Барышев П.Б., Мещерякова Ю.В., Черноусова Н.Я., Гашникова Н.М. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1 субтипов А и В, выделенных на территории Новосибирской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии, иммунобиологии. 2012. № 6. С. 45–52. [Bogachev V.V., Totmenin A.V., Barihshev P.B., Metheryakova Yu.V., Chernousova N.Ya., Gashnikova N.M. Molecular genetic characterization of HIV-1 subtypes A and b allocated on the territory of Novosibirsk region. Journal of Microbiology, Еpidemiology and Immunobiology, 2012, No. 6, pp. 45–52 (In Russ.)].Abecasis A.B., Wensing A.M.J., Paraskevis D., Vercauteren J., Theys K. HIV-1 subtype distribution and its demographic determinants in newly diagnosed patients in Europe suggest highly compartmentalized epidemics. Retrovirology, 2013, Vol. 10, No. 1, рр. 7.Abecasis A.B., Wensing A.M.J., Paraskevis D., Vercauteren J., Theys K. HIV-1 subtype distribution and its demographic determinants in newly diagnosed patients in Europe suggest highly compartmentalized epidemics. Retrovirology, 2013, Vol. 10, No. 1, рр. 7.Захарова Н.Г., Дворак С.И., Плавинский С.Л., Торопов С.Э., Рассохин В.В., Беляков Н.А. Причины неблагоприятных исходов у больных с ВИЧ-инфекцией, принимавших ВААРТ. Часть II // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. Т. 7, № 4. С. 52–63. [Zakharova N.G., Dvorak S.I., Plavinskiyj S.L., Toropov S.Eh., Rassokhin V.V., Belyakov N.A. The causes of unfavorable outcomes among patients taking Haart. Part II. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2015, Vol. 7, No. 4, pp. 52–63 (In Russ.)].Захарова Н.Г., Дворак С.И., Плавинский С.Л., Торопов С.Э., Рассохин В.В., Беляков Н.А. Причины неблагоприятных исходов у больных с ВИЧ-инфекцией, принимавших ВААРТ. Часть II // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. Т. 7, № 4. С. 52–63. [Zakharova N.G., Dvorak S.I., Plavinskiyj S.L., Toropov S.Eh., Rassokhin V.V., Belyakov N.A. The causes of unfavorable outcomes among patients taking Haart. Part II. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2015, Vol. 7, No. 4, pp. 52–63 (In Russ.)].Hicks P.L., Mulvey K.P., Chander G., Fleishman J.A., Josephs J.S., Korthuis P.T., Hellinger J., Gaist P., Gebo K.A. The impact of illicit drug use and substance abuse treatment on adherence to HAART. AIDS Care, 2007, Vol. 19, рр. 1134–1140.Hicks P.L., Mulvey K.P., Chander G., Fleishman J.A., Josephs J.S., Korthuis P.T., Hellinger J., Gaist P., Gebo K.A. The impact of illicit drug use and substance abuse treatment on adherence to HAART. AIDS Care, 2007, Vol. 19, рр. 1134–1140.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.