aidsВИЧ-инфекция и иммуносупрессииHIV Infection and Immunosuppressive Disorders2077-9828Baltic Medical Education Center10.22328/2077-9828-2019-11-2-75-83aids-440Research ArticleЭПИДЕМИОЛОГИЯEPIDEMIOLOGYУРОВЕНЬ И СТРУКТУРА ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ ВИЧ-1 СРЕДИ ПАЦИЕНТОВ БЕЗ ОПЫТА ПРИЕМА АНТИРЕТРОВИРУСНЫХ ПРЕПАРАТОВ С МОМЕНТА НАЧАЛА ПРИМЕНЕНИЯ АНТИРЕТРОВИРУСНОЙ ТЕРАПИИ В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИPREVALENCE AND STRUCTURE OF HIV-1 DRUG RESISTANCE AMONG TREATMENT NAÏVE PATIENTS SINCE THE INTRODUCTION OF ANTIRETROVIRAL THERAPY IN THE RUSSIAN FEDERATIONКириченкоА. А.KirichenkoA. A.

м.н.с. Федерального бюджетного учреждения науки «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора.

kotova-kirichenko@mail.ruКиреевД. Е.KireevD. E.

к.б.н., н.с. Федерального бюджетного учреждения науки «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора.

dmitkireev@yandex.ruЛопатухинА. Э.LopatukhinA. E.

н.с. Федерального бюджетного учреждения науки «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора.

a.lopatukhin@gmail.comМурзаковаА. В.MurzakovaA. V.

м.н.с. Федерального бюджетного учреждения науки «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора.

murzakova_a.v@mail.ruЛаповокИ. А.LapovokI. A.

к.б.н., н.с Федерального бюджетного учреждения науки «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора.

i_lapovok@mail.ruЛаднаяН. Н.LadnayaN. N.

к.б.н., н.с. Федерального бюджетного учреждения науки «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора.

nladnaia@hotmail.comПокровскийВ. В.PokrovskyV. V.

академик РАН, зав. специализированной научно-исследовательской лабораторией эпидемиологии и профилактики СПИД, Федерального бюджетного учреждения науки «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора.

pokrovsky.vad@yandex.ruЦентральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Роспотребнадзор)РоссияCentral Research Institute of Epidemiology Federal service for supervision in the field of protection of the rights of consumers and well-being man’sRussian Federation2019260620191127583Copyright © Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Лопатухин А.Э., Мурзакова А.В., Лаповок И.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В., 20192019Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Лопатухин А.Э., Мурзакова А.В., Лаповок И.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В.Kirichenko A.A., Kireev D.E., Lopatukhin A.E., Murzakova A.V., Lapovok I.A., Ladnaya N.N., Pokrovsky V.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/440Цель исследования

Цель исследования: проанализировать уровень, структуру лекарственной устойчивости и мутаций резистентности во фрагментах гена pol ВИЧ-1, кодирующих протеазу и обратную транскриптазу, к антиретровирусным препаратам среди ВИЧ-инфицированных пациентов, не имеющих опыта антиретровирусной терапии.

Материалы и методы

Материалы и методы. Выполнено исследование 1560 нуклеотидных последовательностей фрагментов гена pol, кодирующих протеазу и часть обратной транскриптазы ВИЧ-1, выделенных от ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта антиретровирусной терапии из всех Федеральных округов Российской Федерации с первым положительным результатом иммунного блоттинга в 1998–2017 гг. Нуклеотидные последовательности участков генома ВИЧ-1 анализировали на наличие мутаций резистентности и уровня прогностической лекарственной устойчивости к антиретровирусным препаратам двумя алгоритмами –согласно алгоритму Стэндфордского университета, оценивали основные мутации лекарственной устойчивости (MDRM) и, используя инструмент CPR, оценивали мутации из листа SDRM 2009 г.

Результаты

Результаты. Уровень распространения мутаций, ассоциированных с прогностической лекарственной устойчивостью низкого, среднего и высокого уровня, составил 11,1%. Наиболее высокая распространенность лекарственной устойчивости обнаружена к препаратам класса ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы (рилпивирин, невирапин, эфавиренз). Уровень распространенности передаваемой лекарственной устойчивости, связанной с мутациями из списка SDRM, составил 5,3%, что классифицируется ВОЗ как умеренный. Однако следует отметить, что с момента широкомасштабного применения антиретровирусных препаратов в России наблюдается тенденция к постепенному росту уровня передаваемой лекарственной устойчивости, и в 2016 году он уже достиг 6,1%.

Заключение

Заключение. Полученные данные демонстрируют необходимость осуществления регулярного надзора за уровнем распространения лекарственной устойчивости ВИЧ к антиретровирусным препаратам среди наивных пациентов в Российской Федерации.

Aim

Aim: to analyze the prevalence, structure of drug resistance and drug resistance mutations in the protease and reverse transcriptase genes of HIV-1 among treatment naïve patients.

Materials and methods

Materials and methods. We analyzed protease and reverse transcriptase sequences from 1560 treatment naïve HIV-infected patients from all Federal Districts of the Russian Federation with the first positive immune blot during 1998–2017. Sequences were analyzed for the presence of drug resistance mutations and predicted drug resistance to antiretroviral drugs using two algorithms — Stanford HIVDR Database (HIVdb) and the 2009 SDRM list (CPR).

Results

Results. The prevalence of drug resistance mutations was 11,1%. More often the prevalence of drug resistance was found for non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor drugs (rilpivirine, nevirapine, efavirenz). The prevalence of transmitted drug resistance associated with mutations from the SDRM list was 5,3%, which is classified by the WHO as a moderate level. However, it should be noted that since the large-scale use of antiretroviral drugs in the Russian Federation, there has been a trend towards a gradual increase in the level of the transmitted drug resistance, and in 2016 it has already reached 6,1%.

Conclusion

Conclusion. The results demonstrate the need for regular surveillance of the prevalence of HIV drug resistance to antiretroviral drugs among treatment naïve patients in the Russian Federation.

ВИЧ-1лекарственная устойчивостьмутацииантиретровирусная терапиярезистентные штаммы ВИЧHIV-1drug resistancemutationsantiretroviral therapyHIV-1 drug resistanceReferencesJoint United Nations Programme (UNAIDS). 90-90-90 An ambitious treatment target to help end the AIDS epidemic. Geneva, 2014, 33 p. URL: http://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/90-90-90_en_0.pdf (October 2014).Joint United Nations Programme (UNAIDS). 90-90-90 An ambitious treatment target to help end the AIDS epidemic. Geneva, 2014, 33 p. URL: http://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/90-90-90_en_0.pdf (October 2014).Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance. Geneva: World Health Organization, 2017, 84 p. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/255880/9789241550055-eng.pdf?sequence=1 (July 2017).Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance. Geneva: World Health Organization, 2017, 84 p. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/255880/9789241550055-eng.pdf?sequence=1 (July 2017).WHO/HIVResNet HIV drug resistance laboratory operational framework. Geneva: World Health Organization, 2017, 73 p. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/259731/9789241512879-eng.pdf?sequence=1 (December 2017).WHO/HIVResNet HIV drug resistance laboratory operational framework. Geneva: World Health Organization, 2017, 73 p. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/259731/9789241512879-eng.pdf?sequence=1 (December 2017).Fokam J., Takou D., Santoro M.M., Akonie H.Z., Kouanfack C., Ceccherini-Silberstein F., Colizzi V. et al. Population-based surveillance of HIV- 1 drug resistance in Cameroonian adults initiating antireviral therapy according to the World Health Organization guidelines. AIDS Res. Hum. Retrovir., 2016, Vol. 32, No. 4, pp. 329–333.Fokam J., Takou D., Santoro M.M., Akonie H.Z., Kouanfack C., Ceccherini-Silberstein F., Colizzi V. et al. Population-based surveillance of HIV- 1 drug resistance in Cameroonian adults initiating antireviral therapy according to the World Health Organization guidelines. AIDS Res. Hum. Retrovir., 2016, Vol. 32, No. 4, pp. 329–333.Quinn T.C. HIV epidemiology and the effects of antiviral therapy on long-term consequences. AIDS, 2008, Vol. 22, Suppl. 3, pp. S7–S12.Quinn T.C. HIV epidemiology and the effects of antiviral therapy on long-term consequences. AIDS, 2008, Vol. 22, Suppl. 3, pp. S7–S12.Ладная Н.Н., Богословская Е.В., Суханова А.Л. и др. Распространенность штаммов ВИЧ, резистентных к антиретровирусным препаратам, передающихся от пациента к пациенту на территории шести субъектов России // Сб. трудов 6-й Всероссийской научно-практической кон- ференции с международным участием «Молекулярная диагностика — 2007». 2007. Т. 1. С. 121–123. [Ladnaya N.N., Bogoslovskaya E.V., Suhanova A.L. et al. The prevalence of HIV strains resistant to antiretroviral drugs, transmitted from patient to patient in the territory of six subjects of Russia. Proceedings of the 6th All-Russian Sientific-Practical Conference with international participation «Molecular Diagnostics — 2007», 2007, Vol. 1, pp. 121–123 (In Russ.)].Ладная Н.Н., Богословская Е.В., Суханова А.Л. и др. Распространенность штаммов ВИЧ, резистентных к антиретровирусным препаратам, передающихся от пациента к пациенту на территории шести субъектов России // Сб. трудов 6-й Всероссийской научно-практической кон- ференции с международным участием «Молекулярная диагностика — 2007». 2007. Т. 1. С. 121–123. [Ladnaya N.N., Bogoslovskaya E.V., Suhanova A.L. et al. The prevalence of HIV strains resistant to antiretroviral drugs, transmitted from patient to patient in the territory of six subjects of Russia. Proceedings of the 6th All-Russian Sientific-Practical Conference with international participation «Molecular Diagnostics — 2007», 2007, Vol. 1, pp. 121–123 (In Russ.)].Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Пекшева О.Ю. Анализ распространенности первичной резистентности ВИЧ к антиретровирусным препаратам в Приволжском федеральном округе // Медицинский альманах. 2016. T. 3, № 43. С. 93–95. [Zaytseva N.N., Parfenova O.V., Peksheva O.Yu. Analysis of the prevalence of primary resistance of HIV to antiretroviral drugs in the Volga Federal District. Medical almanac, 2016, Vol. 3, No. 43, pp. 148–151 (In Russ.)].Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Пекшева О.Ю. Анализ распространенности первичной резистентности ВИЧ к антиретровирусным препаратам в Приволжском федеральном округе // Медицинский альманах. 2016. T. 3, № 43. С. 93–95. [Zaytseva N.N., Parfenova O.V., Peksheva O.Yu. Analysis of the prevalence of primary resistance of HIV to antiretroviral drugs in the Volga Federal District. Medical almanac, 2016, Vol. 3, No. 43, pp. 148–151 (In Russ.)].Lapovok I., Murzakova A., Lopatukhin A., Kireev D., Kazennova E., Bobkova M. et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance mutations among ART-naive patients in Russia from 2005 to 2015. Proceedings of 14th European Meeting on HIV & Hepatitis. Rev. Antivir. Ther. Infect. Dis., 2016, Vol. 4, pp. 83–84.Lapovok I., Murzakova A., Lopatukhin A., Kireev D., Kazennova E., Bobkova M. et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance mutations among ART-naive patients in Russia from 2005 to 2015. Proceedings of 14th European Meeting on HIV & Hepatitis. Rev. Antivir. Ther. Infect. Dis., 2016, Vol. 4, pp. 83–84.Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. T. 3, № 4. C. 34–43. [Dement’eva N.Ye., Sizova N.V., Lisitsyna Z.N., Maklakova V.A., Krutitskaya L.I., Belyakov N.A. Analysis of HIV subtypes and dru-resistant variants circulating in Saint-Petersburg. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 4, pp. 34–43 (In Russ.)].Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. T. 3, № 4. C. 34–43. [Dement’eva N.Ye., Sizova N.V., Lisitsyna Z.N., Maklakova V.A., Krutitskaya L.I., Belyakov N.A. Analysis of HIV subtypes and dru-resistant variants circulating in Saint-Petersburg. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 4, pp. 34–43 (In Russ.)].Bennett D.E., Camacho R.J., Otelea D. et al. Drug Resistance Mutations for Surveillance of Transmitted HIV-1 Drug-Resistance: 2009. PLoS One, 2009, Vol. 4, No. 3, pp. 1–8 (e4724).Bennett D.E., Camacho R.J., Otelea D. et al. Drug Resistance Mutations for Surveillance of Transmitted HIV-1 Drug-Resistance: 2009. PLoS One, 2009, Vol. 4, No. 3, pp. 1–8 (e4724).Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeter M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature. Infect. Genet. Evol., 2016, pp. 150–158.Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeter M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature. Infect. Genet. Evol., 2016, pp. 150–158.Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ-1 IDU-A // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 4. С. 44–51. [Kazennova E.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Vasilyev A.V., Bobkova M.R. Natural polymorphisms of HIV-1 IDU-A variant pol gene. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 4, pp. 44–51 (In Russ.)].Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ-1 IDU-A // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 4. С. 44–51. [Kazennova E.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Vasilyev A.V., Bobkova M.R. Natural polymorphisms of HIV-1 IDU-A variant pol gene. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 4, pp. 44–51 (In Russ.)].Покровская А.В., Козырина Н.В., Гущина Ю.Ш., Юрин О.Г., Суворова З.К., Покровский В.В. Социально-демографический портрет пациента, живущего с ВИЧ и посещающего центры СПИД в России // Терапевтический архив. 2016. Т. 88, № 11. С. 12–16. [Pokrovskaya A.V., Kozyrina N.V., Gushchina Yu.Sh., Yurin O.G., Suvorova Z.K., Pokrovsky V.V. Socio-demographic portrait of a patient living with HIV who visits AIDS centers in Russia. Therapeutic archive, 2016, Vol. 88, No. 11, pp. 12–16 (In Russ.)].Покровская А.В., Козырина Н.В., Гущина Ю.Ш., Юрин О.Г., Суворова З.К., Покровский В.В. Социально-демографический портрет пациента, живущего с ВИЧ и посещающего центры СПИД в России // Терапевтический архив. 2016. Т. 88, № 11. С. 12–16. [Pokrovskaya A.V., Kozyrina N.V., Gushchina Yu.Sh., Yurin O.G., Suvorova Z.K., Pokrovsky V.V. Socio-demographic portrait of a patient living with HIV who visits AIDS centers in Russia. Therapeutic archive, 2016, Vol. 88, No. 11, pp. 12–16 (In Russ.)].Bennett D.E., Myatt M., Bertagnolio S., Sutherland D., Gilks C.F. Recommendations for surveillance of transmitted HIV drug resistance in countries scaling up antiretroviral treatment. Antivir. Ther., 2008, Vol. 13, Suppl. 2, pp. 25–36.Bennett D.E., Myatt M., Bertagnolio S., Sutherland D., Gilks C.F. Recommendations for surveillance of transmitted HIV drug resistance in countries scaling up antiretroviral treatment. Antivir. Ther., 2008, Vol. 13, Suppl. 2, pp. 25–36.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.