aidsВИЧ-инфекция и иммуносупрессииHIV Infection and Immunosuppressive Disorders2077-9828Baltic Medical Education Center10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90aids-491Research ArticleДиагностика, лабораторная службаDiagnostics, laboratory serviceМОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ И ФАРМАКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ ВИЧ У ПАЦИЕНТОВ С ВИРУСОЛОГИЧЕСКОЙ НЕЭФФЕКТИВНОСТЬЮ АНТИРЕТРОВИРУСНОЙ ТЕРАПИИ В АРХАНГЕЛЬСКОЙ ОБЛАСТИHIV MOLECULAR EPIDEMIOLOGY AND PHARMACO-RESISTANCE IN PATIENTS WITH ANTIRETROVIRAL THERAPY FAILURE IN ARKHANGELSK DISTRICTОстанковаЮ. В.OstankovaYu. V.

кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14

St. Petersburg, Russia

shenna1@yandex.ruЩемелевА. Н.SchemelevA. N.

младший научный сотрудник лаборатории вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции, аспирант

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14

St. Petersburg, Russia

tvildorm@gmail.comЗуеваЕ. Б.ZuevaE. V.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории экспериментальной вирусологии

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14

St. Petersburg, Russia

ezueva75@mail.ruЧуринаМ. А.ChurinaM. A.

врач клинико-лабораторной диагностики лаборатории клинико-экспертной и экспресс-диагностики

195067, Санкт-Петербург, Пискаревский пр., д. 49

St. Petersburg, Russia

churina.mari@yandex.ruВалутитеД. Э.ValutiteD. E.

врач клинико-лабораторной диагностики отделения диагностики ВИЧ-инфекции и СПИД-ассоциированных заболеваний

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14

St. Petersburg, Russia

dianavalutite008@gmail.comСеменовА. В.SemenovA. V.

доктор биологических наук, заведующий лабораторией вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции, заместитель директора по инновационной работе; доцент кафедры иммунологии; доцент кафедры клинической лабораторной диагностики 

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14

alexvsemenov@yahoo.comСанкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. ПастераРоссияSt. Petersburg Pasteur InstituteRussian FederationКлиническая инфекционная больница им. С. П. БоткинаРоссияClinical Infectious Diseases Hospital named after S. P. BotkinRussian FederationСанкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И. П. Павлова, Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. МечниковаРоссияSt. Petersburg Pasteur Institute, Pavlov First St. Petersburg State Medical University, North-Western State Medical University named after I. I. MechnikovRussian Federation2019170120201147990Copyright © Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В., 20202020Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В.Ostankova Y.V., Schemelev A.N., Zueva E.V., Churina M.A., Valutite D.E., Semenov A.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/491ВИЧлекарственная устойчивостьмолекулярная эпидемиологиягенотипыген polАрхангельскHIVdrug resistancemolecular epidemiologysubtypegene polArchangelskReferencesUNAIDS. Global HIV and AIDS statistics-2018 fact sheet [Online] 2018; Available from: http://www.unaids.org/en/resources/fact-sheet/. [Accessed 29 September 2018].UNAIDS. Global HIV and AIDS statistics-2018 fact sheet [Online] 2018; Available from: http://www.unaids.org/en/resources/fact-sheet/. [Accessed 29 September 2018].Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. Global and regional distribution of HIV-1 genetic subtypes and recombinants in 2004 // AIDS. 2006. Vol. 20. Р. W13–W23.Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. Global and regional distribution of HIV-1 genetic subtypes and recombinants in 2004 // AIDS. 2006. Vol. 20. Р. W13–W23.Hemelaar J. The origin and diversity of the HIV-1 pandemic // Trends Mol Med. 2012. Vol. 18 (3). P. 182–192.Hemelaar J. The origin and diversity of the HIV-1 pandemic // Trends Mol Med. 2012. Vol. 18 (3). P. 182–192.Beloukas A., Psarris A., Giannelou P., Kostaki E., Hatzakis A., Paraskevis D. Molecular epidemiology of HIV-1 infection in Europe: An overview // Infect. Genet. Evol. 2016. Vol. 46. Р. 180–189. DOI: 10.1016/j.meegid.2016.06.033.Beloukas A., Psarris A., Giannelou P., Kostaki E., Hatzakis A., Paraskevis D. Molecular epidemiology of HIV-1 infection in Europe: An overview // Infect. Genet. Evol. 2016. Vol. 46. Р. 180–189. DOI: 10.1016/j.meegid.2016.06.033.UNAIDS. Global AIDS Update 2016. 2016. Available from: http://www.unaids.org/en/resources/documents/2016/Global-AIDS-update-2016.UNAIDS. Global AIDS Update 2016. 2016. Available from: http://www.unaids.org/en/resources/documents/2016/Global-AIDS-update-2016.Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. 2013. Vol. 15. P. 204–212.Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. 2013. Vol. 15. P. 204–212.Справка Федерального научно-методического центра по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН Центрального НИ эпидемиологии Роспотребнадзора «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в первом полугодии 2019 г.».Information from the Federal Scientific and Methodological Center for the Prevention and Control of AIDS of the Central Federal Research Institution of Epidemiology of RospotrebnadzorFoley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeters M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review // Infect Genet Evol. 2016. Vol. 46. P. 150–158.«HIV infection in the Russian Federation in the first half of 2019» (In Russ.).Niccolai L.M., Toussova O.V., Verevochkin S.V., Barbour R., Heimer R., Kozlov A.P. High HIV prevalence, suboptimal HIV testing, and low knowledge of HIV-positive serostatus among injection drug users in St. Petersburg, Russia // AIDS Behav. 2010. No. 14. P. 932–941.Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeters M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review // Infect Genet Evol. 2016. Vol. 46. P. 150–158.Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р., Коломеец А.Н., Турбина Г.И., Шипулин Г.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. // Терапевтический архив. 2017. № 89 (11). С. 44–49.Niccolai L.M., Toussova O.V., Verevochkin S.V., Barbour R., Heimer R., Kozlov A.P. High HIV prevalence, suboptimal HIV testing, and low knowledge of HIV-positive serostatus among injection drug users in St. Petersburg, Russia // AIDS Behav. 2010. No. 14. P. 932–941.Dukhovlinova E., Masharsky A., Toussova O., Verevochkin S., Solovyeva T., Meringof M., Paintsil E., White E., Barbour R., Heimer R., Kozlov A. Two Independent HIV Epidemics in St. Petersburg, Russia Revealed by Molecular Epidemiology // AIDS Research and Human Retroviruses. 2015. Vol. 31 (6). P. 608–614.Lapovok I.A., Lopatukhin A.E., Kireev D.E., Kazennova E.V., Lebedev A.V., Bobkova M.R., Kolomeets A.N., Turbina G.I., Shipulin G.A., Ladnaya N.N., Pokrovsky V.V. Molecular epidemiological analysis of HIV-1 variants circulating in Russia in 1987–2015. Therapeutic Archive, 2017, Vol. 89 (11), pp. 44–49. (In Russ.).Казеннова Е.В., Нешумаев Д.А., Руковицин Д.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Ракчеева О.В., Васильев А.В., Туманов А.С., Воронцова Г.А., Кузнецова А.В., Лойфман Е.А., Старухина И.Н., Кустова О.И., Половица Н.В., Липская Н.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ эпидемии ВИЧ-инфекции в Благовещенске и Хабаровске (Дальний Восток России) // Вопросы вирусологии. 2014. № 4. С. 31–36.Dukhovlinova E., Masharsky A., Toussova O., Verevochkin S., Solovyeva T., Meringof M., Paintsil E., White E., Barbour R., Heimer R., Kozlov A. Two Independent HIV Epidemics in St. Petersburg, Russia Revealed by Molecular Epidemiology // AIDS Research and Human Retroviruses. 2015. Vol. 31 (6). P. 608–614.Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. Т. 3. № 4. C. 34–44.Kazennova E.V., Neshumaev D.A., Rukavitsyn D.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Rakcheeva O.V., Vasilyev A.V., Tumanov A.S., Vorontsova G.A., Kuznetsova A.V., Loyfman E.A., Staruchina I.N., Kustova O.I., Polovica N.V., Lipskaya N.A., Bobkova M.R. Molecular epidemiological analysis of the HIV infection in the Blagoveshchensk and Khabarovsk Area (Russian Far East). Voprosy virusologii, 2014, No. 4, рр. 31–36. (In Russ.).De Mendoza C. Hot News: HIV Epidemics — Current Burden and Future Prospects // AIDS Rev. 2017. Vol. 19 (4). P. 239.Dement’eva N.Ye., Sizova N.V., Lisitsyna Z.N., Maklakova V.A., Krutitskaya L.I., Belyakov N.A. Analysis of HIV subtypes and drug-resistant variants circulating in St. Petersburg. HIV infection and immunosupression, 2011, Vol. 3, No. 4, pр. 34–44 (In Russ.).Scherrer A., von Wyl V., Yan W., Emergence of Acquired HIV-1 Drug Resistance Almost Stopped in Switzerland: A 15-Year Prospective Cohort Analysis // Clin. Infect. Dis. 2016. Vol. 15. No. 62 (10). P. 1310–1317.De Mendoza C. Hot News: HIV Epidemics — Current Burden and Future Prospects // AIDS Rev. 2017. Vol. 19 (4). P. 239.Gupta R.K., Jordan M.R., Sultan B.J., Hill A., Davis D.H., Gregson J., Sawyer A.W., Hamers R.L., Ndembi N., Pillay D., Bertagnolio S. Global trends in antiretroviral resistance in treatment-naive individuals with HIV after rollout of antiretroviral treatment in resource-limited settings: a global collaborative study and meta-regression analysis // Lancet. 2012. Vol. 380. P. 1250–1258.Scherrer A., von Wyl V., Yan W., Emergence of Acquired HIV-1 Drug Resistance Almost Stopped in Switzerland: A 15-Year Prospective Cohort Analysis // Clin. Infect. Dis. 2016. Vol. 15. No. 62 (10). P. 1310–1317.Pasquet A., Messou E., Gabillard D., Minga A., Depoulosky A., Deuffic-Burban S., Losina E., Freedberg K.A., Danel C., Anglaret X., Yazdanpanah Y. Impact of drug stock-outs on death and retention to care among HIV-infected patients on combination antiretroviral therapy in Abidjan. Cote d’Ivoire // PLoS One. 2010. Vol. 5. e13414.Gupta R.K., Jordan M.R., Sultan B.J., Hill A., Davis D.H., Gregson J., Sawyer A.W., Hamers R.L., Ndembi N., Pillay D., Bertagnolio S. Global trends in antiretroviral resistance in treatment-naive individuals with HIV after rollout of antiretroviral treatment in resource-limited settings: a global collaborative study and meta-regression analysis // Lancet. 2012. Vol. 380. P. 1250–1258.Hirsch M.S., Günthard H.F., Schapiro J.M., Brun-Vézinet F., Clotet B., Hammer S.M., Johnson V.A., Kuritzkes D.R., Mellors J.W., Pillay D., Yeni P.G., Jacobsen D.M., Richman D.D. Antiretroviral drug resistance testing in adult HIV-1 infection: 2008 recommendations of an international AIDS society — USA panel // Clin. Infect. Dis. 2008. Vol. 47 (2). Р. 266–285. doi: 10.1086/589297.Pasquet A., Messou E., Gabillard D., Minga A., Depoulosky A., Deuffic-Burban S., Losina E., Freedberg K.A., Danel C., Anglaret X., Yazdanpanah Y. Impact of drug stock-outs on death and retention to care among HIV-infected patients on combination antiretroviral therapy in Abidjan. Cote d’Ivoire // PLoS One. 2010. Vol. 5. e13414.Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets // Mol. Biol. Evol. 2016. No. 33 (7). P. 1870–1874.Hirsch M.S., Günthard H.F., Schapiro J.M., Brun-Vézinet F., Clotet B., Hammer S.M., Johnson V.A., Kuritzkes D.R., Mellors J.W., Pillay D., Yeni P.G., Jacobsen D.M., Richman D.D. Antiretroviral drug resistance testing in adult HIV-1 infection: 2008 recommendations of an international AIDS society — USA panel // Clin. Infect. Dis. 2008. Vol. 47 (2). Р. 266–285. doi: 10.1086/589297.Попова Е.С., Сорокина Т.А. Информационный бюллетень центра по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями Государственного автономного учреждения здравоохранения Архангельской области «Архангельский клинический кожно-венерологический диспансер». Архангельск, 2018. № 1 (38). Режим доступа: 16.08.2019 http://www.kotlasgb.ru/news/1331/?sphrase_id=951Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets // Mol. Biol. Evol. 2016. No. 33 (7). P. 1870–1874.http://www.kotlasgb.ru/for_patients/profilact/2017%20%D0%B3%D0%BE%D0%B4%20%D0%98%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%BC%20%D0%B1%D1%8E%D0%BB%D0%BB%D0%B5%D1%82%D0%B5%D0%BD%D1%8C.dochttp://www.kotlasgb.ru/news/1331/?sphrase_id=951 http://www.kotlasgb.ru/for_patients/profilact/2017%20%D0%B3%D0%BE%D0%B4%20%D0%98%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%BC%20%D0%B1%D1%8E%D0%BB%D0%BB%D0%B5%D1%82%D0%B5%D0%BD%D1%8C.doc Popova E.S., Sorokina T.A. Newsletter of the Center for the Prevention and Control of AIDS and Infectious Diseases of the State Autonomous Institution of Healthcare of the Arkhangelsk Region «Arkhangelsk Clinical Dermatovenerologic Dispensary» Arkhangelsk, 2018, No. 1 (38). (In Russ.).Kazennova E., Laga V., Lapovok I., Glushchenko N., Neshumaev D., Vasilyev A., Bobkova M. HIV-1 Genetic Variants in the Russian Far East // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2014. No. 8. P. 742–752.Kazennova E., Laga V., Lapovok I., Glushchenko N., Neshumaev D., Vasilyev A., Bobkova M. HIV-1 Genetic Variants in the Russian Far East // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2014. No. 8. P. 742–752.Choudinovskikh O., Denissenko M. Migration Between CIS Countries: Trends and Policy. Search Working Paper (January). WP3/06. Available from: http://www.ub.edu/searchproject/wp-content/uploads/2013/02/WP_3_6.pdfChoudinovskikh O., Denissenko M. Migration Between CIS Countries: Trends and Policy. Search Working Paper (January). WP3/06. Available from: http://www.ub.edu/searchproject/wp-content/uploads/2013/02/WP_3_6.pdfAibekova L., Foley B., Hortelano G., Raees M., Abdraimov S., Toichuev R., Ali S. Molecular epidemiology of HIV-1 subtype A in former Soviet Union countries // PLoS One. 2018. No. 13 (2). e0191891.Aibekova L., Foley B., Hortelano G., Raees M., Abdraimov S., Toichuev R., Ali S. Molecular epidemiology of HIV-1 subtype A in former Soviet Union countries // PLoS One. 2018. No. 13 (2). e0191891.Бородкина О.И. Проблемы профилактики ВИЧ/СПИДа среди международных мигрантов // Социальное обслуживание семей и детей: научно-методический сборник. 2016. № 8. С. 102–109.Borodkina O.I. Problems of HIV/AIDS prevention among international migrants. Social Services for Families and Children. A Scientific and Methodological Collection, 2016, No. 8, рр. 102–109. (In Russ.).Софронов А.Г., Добровольская А.Е., Пашковский В.Э., Чащин В.П., Чащин М.В., Зуева Л.П., Асланов Б.И., Гончаров А.Е. Распространенность социально-значимых инфекционных заболеваний у трудовых мигрантов в Санкт-Петербурге // Медицинский академический журнал. 2014. № 14 (4). С. 79–83.Sofronov A.G., Dobrovolskaya A.E., Pashkovsky V.E., Chashchin V.P., Chashchin M.V., Zueva L.P., Aslanov B.I., Goncharov A.E. The prevalence of socially significant infectious diseases among labor migrants in St. Petersburg. Medical Academic Journal, 2014, Vol. 14 (4), рр. 79–83. (In Russ.).Казеннова Е.В., Лага В.Ю., Громов К.Б., Санков М.Н., Попова Е.С., Игумнова Е.Г., Опарина Е.Н., Сорокина Т.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ ВИЧ-инфекции в северных портовых городах России // Вопросы вирусологии. 2017. Т. 62. № 4. С. 154–161.Kazennova E.V., Laga V.Yu., Gromov K.B., Sankov M.N., Popova E.S., Igumnova E.G., Oparina E.N., Sorokina T.A., Bobkova M.R. Molecular epidemiological analysis of HIV infection in northern seaports of Russia. Voprosy virusologii, 2017, Vol. 62, No. 4, рp. 154–161 (In Russ.).Кравченко А.В. Современные схемы антиретровирусной терапии // Медицинский совет. 2016. № 17. С. 84–89.Kravchenko A.V. Current regimens for antiretroviral therapy. Medical Council, 2016, No. 17, рp. 84–89 (In Russ.)

The authors declare that there are no conflicts of interest present.