aidsВИЧ-инфекция и иммуносупрессииHIV Infection and Immunosuppressive Disorders2077-9828Baltic Medical Education Center10.22328/2077-9828-2015-7-3-56-66aids-96Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL STUDIESАНАЛИЗ РЕЗИСТЕНТНОСТИ ВИЧ В ПРИВОЛЖСКОМ ФЕДЕРАЛЬНОМ ОКРУГЕ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИANALYSIS OF HIV DRUGS RESISTANCE IN PRIVOLZHSKIY FEDERAL DISTRICT OF THE RUSSIAN FEDERATIONКазенноваЕлена ВалерьевнаKazennovaYe. V.kazennova@rambler.ruЛаповокИлья АндреевичLapovokI. A.01.e-mail: i_lapovok@mail.ruЛебедевАлексей ВладимировичLebedevA. V.swan_236@mail.ruЛагаВита ЮрьевнаLagaV. J.noemail@neicon.ruГлущенкоНаталия ВладимировнаGlushchenkoN. V.noemail@neicon.ruЗверевСергей ЯковлевичZverevS. Ya.aidszavlab@mail.ruНистратоваЮлия ИгоревнаNistratovaYu. I.lulyaliki@yandex.ruЗайцеваНаталья НиколаевнаZaytsevaN. N.vtashca@mail.ruПарфеноваОльга ВладимировнаParfenovaO. V.prokaids@mail.ruГерасимовВалерий ВалентиновичGerasimovV. V.noemail@neicon.ruШошокинВалерий АлексеевичShoshokinV. A.noemail@neicon.ruБобковаМарина РидовнаBobkovaM. R.mrbobkova@mail.ruИнститут вирусологии им. Д.И. Ивановского «ФНИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава РоссииРоссияIvanovsky institute of virology FSBI «N.F. Gamaleya FRCEM» of the Ministry of Health of RussiaRussian FederationПермский краевой центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниямиРоссияPerm Regional Center for Prevention and Control of AIDS and infectious diseasesRussian FederationННИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора, Приволжский окружной центр по профилактике и борьбе со СПИДРоссияFederal Budget Institution of Science «Nizhny Novgorod Scientific and Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after Academician I.N. Blokhina» (Rospotrebnadzor), Volga Federal Center for the Prevention and Control of AIDSRussian FederationРеспубликанский центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями Министерства здравоохранения Республики ТатарстанРоссияThe Republic Center for Prevention and Control of AIDS and Infectious DiseasesRussian Federation201530092015735666Copyright © Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лебедев А.В., Лага В.Ю., Глущенко Н.В., Зверев С.Я., Нистратова Ю.И., Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Герасимов В.В., Шошокин В.А., Бобкова М.Р., 20152015Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лебедев А.В., Лага В.Ю., Глущенко Н.В., Зверев С.Я., Нистратова Ю.И., Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Герасимов В.В., Шошокин В.А., Бобкова М.Р.Kazennova Y.V., Lapovok I.A., Lebedev A.V., Laga V.J., Glushchenko N.V., Zverev S.Y., Nistratova Y.I., Zaytseva N.N., Parfenova O.V., Gerasimov V.V., Shoshokin V.A., Bobkova M.R.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/96

Проведен анализ 236 нуклеотидных последовательностей фрагментов гена pol вариантов ВИЧ-1, циркулирующих на территории Приволжского федерального округа (гг. Пермь, Казань, Нижний Новгород). Показано, что в регионе доминируют варианты ВИЧ подтипа А1 (95,2%), кроме того, выявлены варианты ВИЧ подтипов и рекомбинантных форм B (2%), CRF03_AB (1,2%), и, в единичных случаях,- C, G, CRF02_AG. Филогенетический анализ подтвердил, что все вирусы подтипа А1 относятся к варианту IDU-A, а вирусы других подтипов образуют общие ветви с родственными штаммами. Лишь у 47,5% пациентов, получающих АРТ, с вирусологической неэффективностью лечения выявлены мутации ЛУ. Отсутствие мутаций ЛУ у 52,5% пациентов, находящихся на АРТ, с высокой ВН может свидетельствовать о низкой приверженности лечению данных лиц.

The nucleotide sequences of 236 the pol gene fragments of HIV-1 variants circulating in the territory of the Volga Federal District (Perm, Kazan, Nizhny Novgorod) were analyzed. It was shown that HIV subtype A1 variants dominate (95,2%) in this region. In addition, HIV variants of subtype B (2%), CRF03_AB (1,2%), and in rare cases - subtypes C, G, CRF02_AG were also revealed. Phylogenetic analysis found that the HIV subtype A1 variants relates to the IDU-A variant, and other viruses form a common branch with the related strains. Only in 47,5% of patients receiving ART, with virological failure drug resistance mutations were identified. The absence of drug resistance mutations at 52,5% patients on ART with high viral load may indicate poor adherence to treatment of these persons.

ВИЧ-1генотипированиемутации лекарственной устойчивостифилогенетический анализHIV-1genotypingdrug resistance mutationsphylogenetic analysisReferencesБобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. - М.: Издательство «Человек», 2014. - 285 сБобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. - М.: Издательство «Человек», 2014. - 285 сЮрин О.Г., Кравченко А.В., Канестри В.Г. Глава 19. Лекарственная терапия больных с ВИЧ-инфекцией. В кн. под ред. акад. РАМН В.В. Покровского «ВИЧ-инфекция и СПИД национальное руководство». - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2013. - 606 сЮрин О.Г., Кравченко А.В., Канестри В.Г. Глава 19. Лекарственная терапия больных с ВИЧ-инфекцией. В кн. под ред. акад. РАМН В.В. Покровского «ВИЧ-инфекция и СПИД национальное руководство». - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2013. - 606 сПокровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко А.В., Беляева В.В., Канестри В.Г., Афонина Л.Ю., Ермак Т.Н., Буравцова Е.В., Шахгильдян В.И., Козырина Н.В., Нарсия Р.С., Зимина В.Н., Покровская А.В., Ефремова О.С. Протоколы диспансерного наблюдения и лечения больных ВИЧ-инфекцией // Эпидемиол. и инфекц. бол. - 2014. - № 6. - С. 17Покровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко А.В., Беляева В.В., Канестри В.Г., Афонина Л.Ю., Ермак Т.Н., Буравцова Е.В., Шахгильдян В.И., Козырина Н.В., Нарсия Р.С., Зимина В.Н., Покровская А.В., Ефремова О.С. Протоколы диспансерного наблюдения и лечения больных ВИЧ-инфекцией // Эпидемиол. и инфекц. бол. - 2014. - № 6. - С. 17Покровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко А.В., Беляева В.В., Канестри В.Г., Афонина Л.Ю., Ермак Т.Н., Буравцова Е.В., Шахгильдян В.И., Козырина Н.В., Нарсия Р.С., Зимина В.Н., Покровская А.В., Ефремова О.С. Протоколы диспансерного наблюдения и лечения больных ВИЧ-инфекцией // Эпидемиол. и инфекц. бол. - 2014. - № 6. - С. 27Покровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко А.В., Беляева В.В., Канестри В.Г., Афонина Л.Ю., Ермак Т.Н., Буравцова Е.В., Шахгильдян В.И., Козырина Н.В., Нарсия Р.С., Зимина В.Н., Покровская А.В., Ефремова О.С. Протоколы диспансерного наблюдения и лечения больных ВИЧ-инфекцией // Эпидемиол. и инфекц. бол. - 2014. - № 6. - С. 27Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Васильев А.В. Лага В.Ю., Грезина Л.А., Волова Л.Ю., Бобкова М.Р. Проблемы субтипирования ВИЧ на основе анализа гена pol и способы их разрешения // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. - 2010. - № 3. - С. 42-48Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Васильев А.В. Лага В.Ю., Грезина Л.А., Волова Л.Ю., Бобкова М.Р. Проблемы субтипирования ВИЧ на основе анализа гена pol и способы их разрешения // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. - 2010. - № 3. - С. 42-48Бобков А.Ф., Зверев С.Я., Бобкова М.Р., Осташова В.Л., Красникова Л.А., Зубриков В.В., Жалнин В.В, Казеннова Е.В., Ханина Т.А., Костина Л.Е., Крендель Б.Ю., Иванова Э.С., Юрганова Г.А., Лузин П.М., Покровский В.В. Эпидемиологическая и генетическая характеристика первых 40 случаев ВИЧ-инфекции на территории Пермской области // Вопросы вирусологии. - 2000. - № 4. - С. 18-21Бобков А.Ф., Зверев С.Я., Бобкова М.Р., Осташова В.Л., Красникова Л.А., Зубриков В.В., Жалнин В.В, Казеннова Е.В., Ханина Т.А., Костина Л.Е., Крендель Б.Ю., Иванова Э.С., Юрганова Г.А., Лузин П.М., Покровский В.В. Эпидемиологическая и генетическая характеристика первых 40 случаев ВИЧ-инфекции на территории Пермской области // Вопросы вирусологии. - 2000. - № 4. - С. 18-21Сандырева Т.П., Герасимова Н.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Куевда Д.А., Шипулин Г.А., Подымова А.С. Филогенетический анализ в эпидемиологических расследованиях случаев ВИЧ-инфекции // Эпидемиол. и инфекц. бол. - 2014. - № 1. - С. 17Сандырева Т.П., Герасимова Н.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Куевда Д.А., Шипулин Г.А., Подымова А.С. Филогенетический анализ в эпидемиологических расследованиях случаев ВИЧ-инфекции // Эпидемиол. и инфекц. бол. - 2014. - № 1. - С. 17Pineda-Peña A.C., Schrooten Y., Vinken L., Ferreira F., Li G., Trovão N.S., Khouri R., Derdelinckx I., De Munter P., Kücherer C., Kostrikis L.G., Nielsen C., Littsola K., Wensing A., Stanojevic M., Paredes R., Balotta C., Albert J., Boucher C., Gomez-Lopez A., Van Wijngaerden E., Van Ranst M., Vercauteren J., Vandamme A.M., Van Laethem K. Trends and predictors of transmitted drug resistance (TDR) and clusters with TDR in a local Belgian HIV-1 epidemic // PLoS One. - 2014. - N7. - e101738Pineda-Peña A.C., Schrooten Y., Vinken L., Ferreira F., Li G., Trovão N.S., Khouri R., Derdelinckx I., De Munter P., Kücherer C., Kostrikis L.G., Nielsen C., Littsola K., Wensing A., Stanojevic M., Paredes R., Balotta C., Albert J., Boucher C., Gomez-Lopez A., Van Wijngaerden E., Van Ranst M., Vercauteren J., Vandamme A.M., Van Laethem K. Trends and predictors of transmitted drug resistance (TDR) and clusters with TDR in a local Belgian HIV-1 epidemic // PLoS One. - 2014. - N7. - e101738Gupta R.K., Jordan M.R., Sultan B.J., Hill A., Davis D.H., Gregson J., Sawyer A.W., Hamers R.L., Ndembi N., Pillay D., Bertagnolio S. Global trends in antiretroviral resistance in treatment-naive individuals with HIV after rollout of antiretroviral treatment in resourcelimited settings: a global collaborative study and meta-regression analysis // Lancet. - 2012. - № 380. - P. 1250-1258.Gupta R.K., Jordan M.R., Sultan B.J., Hill A., Davis D.H., Gregson J., Sawyer A.W., Hamers R.L., Ndembi N., Pillay D., Bertagnolio S. Global trends in antiretroviral resistance in treatment-naive individuals with HIV after rollout of antiretroviral treatment in resourcelimited settings: a global collaborative study and meta-regression analysis // Lancet. - 2012. - № 380. - P. 1250-1258.Европейские рекомендации по лекарственной устойчивости ВИЧ (2009 г., обновленные). - URL: http://www.rega.kuleuven.be/cev (дата обращения 24.04.2015 г.).Европейские рекомендации по лекарственной устойчивости ВИЧ (2009 г., обновленные). - URL: http://www.rega.kuleuven.be/cev (дата обращения 24.04.2015 г.).Надзор за распространением штаммов ВИЧ, резистентных к антиретровирусным препаратам: Методические рекомендации МР 3.1.5.0075/1-13, Роспотребнадзор. - 2013. - 68 сНадзор за распространением штаммов ВИЧ, резистентных к антиретровирусным препаратам: Методические рекомендации МР 3.1.5.0075/1-13, Роспотребнадзор. - 2013. - 68 сЛага В.Ю., Казеннова Е.В., Васильев А.В., Лаповок И.А., Исмаилова А., Бейшеева Н., Асыбалиева Н., Бобкова М.Р. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ, распространенных на территории Киргизии // Вопросы вирусологии. - 2012. - № 5. - С. 26-32Лага В.Ю., Казеннова Е.В., Васильев А.В., Лаповок И.А., Исмаилова А., Бейшеева Н., Асыбалиева Н., Бобкова М.Р. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ, распространенных на территории Киргизии // Вопросы вирусологии. - 2012. - № 5. - С. 26-32Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences // Journal of Molecular Evolution. - 1980. - № 2. - P. 111-120.Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences // Journal of Molecular Evolution. - 1980. - № 2. - P. 111-120.Справка - ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2013 г. - URL: http://wwwhrvrussia.ru/doc/docs.shtml (дата обращения 24.04.2015 г.). Spravka - VICH infekciya v Rossijskoj Federacii v 2013 g. - URL: http://www.hivrussia.ru/doc/docs.shtml (data obrashcheniya 24.04.2015 g.).Справка - ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2013 г. - URL: http://wwwhrvrussia.ru/doc/docs.shtml (дата обращения 24.04.2015 г.). Spravka - VICH infekciya v Rossijskoj Federacii v 2013 g. - URL: http://www.hivrussia.ru/doc/docs.shtml (data obrashcheniya 24.04.2015 g.).Бобков А.Ф., Казеннова Е.В., Селимова Л.М., Ханина Т.А., Ладная Н.Н., Бобкова М.Р., Кравченко А.В., Рябов Г.С., Суханова А.Л., Буравцова Е.В., Покровский В.В., Weber J.N. Молекулярно-вирусологические особенности эпидемии ВИЧ-инфекции в России и других странах СНГ // Вестн. РАМН. - 2003. - № 12. - С. 83-85Бобков А.Ф., Казеннова Е.В., Селимова Л.М., Ханина Т.А., Ладная Н.Н., Бобкова М.Р., Кравченко А.В., Рябов Г.С., Суханова А.Л., Буравцова Е.В., Покровский В.В., Weber J.N. Молекулярно-вирусологические особенности эпидемии ВИЧ-инфекции в России и других странах СНГ // Вестн. РАМН. - 2003. - № 12. - С. 83-85Суханова А.Л., Казеннова Е.B., Бобкова М.Р., Кравченко А.В., Селимова Л.М., Ханина Т.А., Бобков А.Ф., Покровский В.В. Варианты вируса иммунодефицита человека типа 1, обнаруживаемые в России среди инфицированных половым путем // Вопросы вирусологии.- 2004. - № 1. - С. 4-7Суханова А.Л., Казеннова Е.B., Бобкова М.Р., Кравченко А.В., Селимова Л.М., Ханина Т.А., Бобков А.Ф., Покровский В.В. Варианты вируса иммунодефицита человека типа 1, обнаруживаемые в России среди инфицированных половым путем // Вопросы вирусологии.- 2004. - № 1. - С. 4-7Kazennova E., Laga V., Lapovok I., Glushchenko N., Neshumaev D., Vasilyev A., Bobkova M. HIV-1 Genetic Variants in the Russian Far East // AIDS Res. Hum. Retroviruses. - 2014. - № 8. - P. 742-752.Kazennova E., Laga V., Lapovok I., Glushchenko N., Neshumaev D., Vasilyev A., Bobkova M. HIV-1 Genetic Variants in the Russian Far East // AIDS Res. Hum. Retroviruses. - 2014. - № 8. - P. 742-752.Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. HIV-1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia // AIDS Res Hum Retroviruses. - 2014. - № 6. - P. 592-597.Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. HIV-1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia // AIDS Res Hum Retroviruses. - 2014. - № 6. - P. 592-597.Melikian G.L., Rhee S.Y., Taylor J., Fessel W.J., Kaufman D., Towner W., Troia-Cancio P.V., Zolopa A., Robbins G.K., Kagan R., Israelski D., Shafer R.W. Standardized Comparison of the Relative Impacts of HIV-1 ReverseTranscriptase (RT) Mutations on Nucleoside RT Inhibitor Susceptibility // Antimicrob. Agents Chemother. - 2012. - № 5. - P. 2305-2313.Melikian G.L., Rhee S.Y., Taylor J., Fessel W.J., Kaufman D., Towner W., Troia-Cancio P.V., Zolopa A., Robbins G.K., Kagan R., Israelski D., Shafer R.W. Standardized Comparison of the Relative Impacts of HIV-1 ReverseTranscriptase (RT) Mutations on Nucleoside RT Inhibitor Susceptibility // Antimicrob. Agents Chemother. - 2012. - № 5. - P. 2305-2313.Kolomeets A.N., Varghese V., Lemey P., Bobkova M.R., Shafer R.W. A uniquely prevalent nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutation in Russian subtype A HIV-1 viruses // AIDS. - 2014. - № 17. - Р. 1-8.Kolomeets A.N., Varghese V., Lemey P., Bobkova M.R., Shafer R.W. A uniquely prevalent nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutation in Russian subtype A HIV-1 viruses // AIDS. - 2014. - № 17. - Р. 1-8.Беляева В.В., Кравченко А.В. Приверженность высокоактивной противоретровирусной терапии при ВИЧ-инфекции // Шаги профессионал. - 2010. - № 6. - С. 12-21.Беляева В.В., Кравченко А.В. Приверженность высокоактивной противоретровирусной терапии при ВИЧ-инфекции // Шаги профессионал. - 2010. - № 6. - С. 12-21.Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ IDU-A // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессия. - 2012. - № 4. - С. 44Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ IDU-A // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессия. - 2012. - № 4. - С. 44

The authors declare that there are no conflicts of interest present.