Первичная лекарственная устойчивость среди впервые выявленных пациентов с ВИЧ-1 в Санкт-Петербурге

У специалистов есть опасения, что широкое использование антиретровирусных препаратов для лечения инфекции, вызванной вирусом иммунодефицита человека 1 (ВИЧ-1), может привести к возникновению передачи лекарственно- устойчивого вируса среди лиц, впервые инфицированных ВИЧ-1. Россия — одна из растущего числа стран, где лекарственно-устойчивый ВИЧ становится серьезной проблемой для здоровья, поскольку он может снизить эффективность антиретровирусной терапии на уровне населения.

Материалы и методы. Проведен генетический анализ гена pol, полученного из плазмы ВИЧ-1, среди впервые выявленных пациентов с ВИЧ-1, не получавших антиретровирусную терапию, в период с ноября 2018 г. по октябрь 2019 г. в СПБ ГБУЗ «Клинической инфекционной больнице им. С. П. Боткина». Использовали полимеразную цепную реакцию с обратной транскриптазой (ОТ-ПЦР) с последующим прямым секвенированием продуктов ПЦР для определения распространенности мутаций, вызывающих первичную лекарственную устойчивость. Генотипы ВИЧ-1 определяли филогенетическим анализом.

Результаты. Преобладающим подтипом ВИЧ-1 был A1 (87,2%), далее за ним следовали B (11,8%) и CRF06_cpx (1%). Общая распространенность первичной лекарственной устойчивости составляла 11%. Вирус с известными мутациями, придающими устойчивость к любым ингибиторам нуклеозидной обратной транскриптазы (НИОТ), был обнаружен у 8 человек, к любым не-НИОТ — у 5 пациентов и к любым ингибиторам протеаз — в одном случае. Вирус с множественной лекарственной устойчивостью выявлен у 2 человек (2%).

Заключение. Распространение генотипов ВИЧ-1 в Санкт-Петербурге (Россия) разнообразно. Растущая распространенность первичной лекарственной устойчивости у пациентов, ранее не получавших антиретровирусную терапию, демонстрирует важность постоянного мониторинга из-за проблем, которые возникают при дальнейшем лечении.

1. UNAIDS (2018). UNAIDS data 2018. State of the epidemic in Eastern Europe and Central Asia. Р. 273–278.

2. Beyrer C., Wirtz A.L., O’Hara G., Léon N., Kazatchkine M. The expanding epidemic of HIV-1 in the Russian Federation // PLOS Medicine. 2017. Vol. 14 (11). e1002462. https://doi.org/10.1371/journal.pmed.1002462.

3. Clark F. World Report: Gaps remain in Russia’s response to HIV/AIDS // The Lancet. 2016. Vol. 388 (10047). Р. 857–858. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(16)31480-5.

4. Belyakov N.A., Rassokhin V.V., Semenov A.V., Konovalova N.V., Ogurtsova S.V., Svetlichnaya Yu.S., Boeva E.V., Bobreshova A.S., Esaulenko E.V., Sukhoruk A.A. HIV infection and comorbidal conditions in the northwestern federal district of the Russian Federation in 2016 // Аnalytical review. St. Petersburg, 2017.

5. UNAIDS. Global HIV & AIDS statistics 2020. Р. 1–7.

6. UNAIDS 90–90–90, an ambitious treatment target to help end the AIDS epidemic. 2017. Р. 1–40.

7. Phillips A.N., Stover J., Cambiano V., Nakagawa F., Jordan M.R., Pillay D. et al. Impact of HIV drug resistance on HIV/AIDS associated mortality, new infections and antiretroviral therapy program costs in sub-Saharan Africa // Journal of Infectious Diseases. 2017. Vol. 215 (9). Р. 1362–1365.

8. WHO (2017). Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance. Р. 1–84.

9. Hofstra L.M. High rates of transmission of drug-resistant HIV in Aruba resulting in reduced susceptibility to the WHO recommended first-line regimen in nearly half of newly diagnosed HIV-infected patients // Clinical Infectious Diseases. 2017. Vol. 64. Р. 1092–1097.

10. Sanchez Rivas E., Nijhuis M., Bank L.E.A., Wilkinson E, Kelly K., Boden D., Hurley A., Zhang L. et al. HIV-1 drug resistance in newly infected individuals // The Journal of the American Medical Association. 1999. Vol. 282 (12). Р. 1135–1141.

11. Chauhan C.K., Lakshmi P.V.M., Sagar V., Sharma A., Arora S.K., Kumar R. Primary HIV Drug Resistance among Recently Infected Cases of HIV in North-West India // AIDS Research and Treatment. 2019. 8 p.

12. Lebedeva N.N., Zverev S.Y., Kulagin V.V., Kurina N.V., Pronin A.Yu., Mikova O.E., Milovanova I.I., Polovitsa N.V., Sandyreva T.P., Sizova N.V., Sklyar L.F., Tertyshnaya Yu. N., Belkina N.S., Shemshura A.B., Bobkova M.R. HIV drug resistance early warning indicators and their assessment in some regions of Russia // HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. 2018. Vol. 10 (4). Р. 67–75.

13. Struck D., Lawyer G., Ternes A.M., Schmit J.C., Bercoff D.P. COMET: adaptive context-based modeling for ultrafast HIV-1 subtype identification // Nucleic Acids Research. 2014. Vol. 42. Р. 144.

14. Pineda-Pena A.C., Faria N.R., Imbrechts S., Libin P., Abecasis A.B., Deforche K. et al. Automated subtyping of HIV-1 genetic sequences for clinical and surveillance purposes: performance evaluation of the new REGA version 3 and seven other tools // Infection, Genetics and Evolution. 2013. Vol. 19. Р. 337–348.

15. WHO (2016). Consolidated guidelines on the use of antiretroviral drugs for treating and preventing HIV infection. Recommendations for a public health approach. 2nd ed. Clinical guidelines HIV diagnosis, 2016. Р. 1–34.

16. Maldonado J. The HIV-1 Reverse Transcriptase A62V Mutation Influences Replication Fidelity and Viral Fitness in the Context of Multi-Drug- Resistant Mutations // Viruses. 2018. Vol. 10 (7). Р. 376.

17. Hylton E., Wirtz A.L., Zelaya C.E, Latkin C., Peryshkina A., Mogilnyi V. et al. Sexual Identity, Stigma, and Depression: the Role of the «Antigay Propaganda Law» in Mental Health among Men Who Have Sex with Men in Moscow, Russia // Journal of Urban Health. 2017. Vol. 94 (3). Р. 319–329.

18. Wirtz A.L., Zelaya C.E., Peryshkina A., Latkin C., Mogilnyi V., Galai N. et al. Social and structural risks for HIV among migrant and immigrant men who have sex with men in Moscow, Russia: Implications for prevention // AIDS Care. 2014. Vol. 26 (3). Р. 387–395.

19. Deniz G., Cristiana O., Serhat U., Josip B The growing HIV epidemic in Central Europe: a neglected issue? // Journal of Virus Eradication. 2016. Vol. 2 (3). Р. 156–161.

20. Peltzer K. Correlates of HIV infection among people visiting public HIV counseling and testing clinics in Mpumalanga, South Africa // African Health Sciences. 2012. Vol. 12. Р. 8–16.

21. Zenin P.V., Pronin A., Serkov I.L., Khametova K.M., Orlova-Morozova E.A., Giliazova A.V. et al. Molecular epidemiology of HIV-1 strains in the Moscow Region // Problems of Virology. 2010. Vol. 55. Р. 25–29.

22. Vinogradova A., Delgado E., Rakhmanova A., Yakovlev A., Cuevas M. T., Nájera R Thomson M. M. Molecular Epidemiology of HIV-1 in St. Petersburg, Russia: Predominance of Subtype A, Former Soviet Union Variant, and Identification of Intrasubtype Subclusters // Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. 2009. Vol. 51 (3). Р. 332–339.

23. Lebedev A., Мoskaleychik F., Pronin A., Kazennova E., Bobkova M. Human Immunodeficiency Virus-1 Diversity in the Moscow Region, Russia: Phylodynamics of the Most Common Subtypes // Frontiers in Microbiology. 2019. Vol. 10. doi: 10.3389/fmicb.2019.00320.

24. Bbosa N., Kaleebu P., Ssemwanga D. HIV subtype diversity worldwide // Current Opinion in HIV and AIDS. 2019. Vol. 14 (3). Р. 153–160.

25. Buchacz K., Young B., Palella F. J., Armon C., Brooks J. T… Trends in use of genotypic resistance testing and frequency of major drug resistance among antiretroviral-naive persons in the HIV Outpatient Study, 1999–2011 // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 2015. Vol. 70 (8). Р. 2337–2346.

26. Hofstra L.M. et al. Transmission of HIV Drug Resistance and the Predicted Effect on Current First-line Regimens in Europe // Clinical infectious diseases: an official publication of the Infectious Diseases Society of America. 2016. Vol. 62. Р. 655–663.

27. Zhao S., Feng Y., Hu J. et al. Prevalence of Transmitted HIV drug resistance in antiretroviral treatment naïve newly diagnosed individuals in China // Scientific Reports. 2018. Vol. 8. Р. 12273.

28. Pace C.A., Lioznov D., Cheng D.M., Wakeman S.E., Raj A., Walley A.Y., Samet J.H. Sexually transmitted infections among HIV-infected heavy drinkers in St Petersburg, Russia. International // Journal of STD & AIDS. 2012. Vol. 23 (12). Р. 853–858.

29. Bennett D.E., Myatt M., Bertagnolio S., Sutherland D., Gilks C.F. Recommendations for surveillance of transmitted HIV drug resistance in countries scaling up antiretroviral treatment // Antiviral Therapy. 2008. Vol. 13 (2). p. 25–36.

30. Kirichenko A.A., Kireev D.E., Lopatukhin A.E., Murzakova A.V., Lapovok I.A., Ladnaya N.N., Pokrovsky V.V. Prevalence and structure of HIV-1 drug resistance among treatment naïve patients since the introduction of antiretroviral therapy in the Russian Federation // HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. 2019. Vоl. 11 (2). Р. 75–83.

31. Oroz M., Begovac J., Planinić A. et al. Analysis of HIV-1 diversity, primary drug resistance and transmission networks in Croatia // Scientific Reports. 2019. Vоl. 9. Р. 17307.

32. Zaitseva N.N., Parfenova O.Yu. Analysis of spread of initial resistance of HIV to antiretroviral medicines in Privolzhsky Federal District // World of Transport and Transportation. 2016. Vоl. 14 (3). Р. 93–35.