МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВАРИАНТОВ ВИЧ-1, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ЕВРЕЙСКОЙ АВТОНОМНОЙ ОБЛАСТИ
В. О. Котова,
О. Е. Троценко,
Л. А. Балахонцева,
Е. А. Базыкина,
О. А. Янович,
Ю. В. Щиканов,
М. Н. Павлова,
Т. И. Шмакова
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2018-10-4-90-99
- Р Р‡.МессенРТвЂВВВВВВВВжер
- РћРТвЂВВВВВВВВнокласснРСвЂВВВВВВВВРєРСвЂВВВВВВВВ
- LiveJournal
- Telegram
- ВКонтакте
- РЎРєРѕРїРСвЂВВВВВВВВровать ссылку
Полный текст:
Аннотация
Цель исследования: проведение молекулярно-эпидемиологического анализа вариантов ВИЧ-1, циркулирующих на территории Еврейской автономной области. Материалы и методы. Обследовано 56 пациентов с диагнозом «ВИЧ-инфекция». Мутации резистентности выявляли методом секвенирования амплифицированных фрагментов гена pol, кодирующего протеазу и часть обратной транскриптазы ВИЧ-1, с использованием тест-системы «АмплиСенс® HIV-ResistSeq». Филогенетический анализ выполняли с помощью программы MEGA v. 6.0. Результаты. Oтмечено незначительное преобладание рекомбинантной формы ВИЧ-1 СRF63_02A1, которая была обнаружена у 25 пациентов (44,6%). Субсубтип А6 выявлен у 23 человек (41,1%). В 6 случаях был обнаружен субтип В (10,7%), в 2 (3,6%) — субтип С. Первичные мутации лекарственной устойчивости, а значит, и необходимость замены терапии были выявлены у 9 пациентов, получающих антиретровирусную терапию. Показатель распространенности мутаций лекарственной устойчивости среди «наивных» пациентов составил 3,8%.
Ключевые слова
Об авторах
В. О. Котова
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Россия
Россия
Котова Валерия Олеговна — зав. лабораторией эпидемиологии и профилактики вирусных гепатитов и СПИДа
680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2, (4212) 46-18-54
О. Е. Троценко
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Россия
Россия
Троценко Ольга Евгеньевна — д.м.н., директор
680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2, (4212) 32-52-28
Л. А. Балахонцева
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Россия
Россия
Балахонцева Людмила Анатольевна — руководитель Дальневосточного окружного центра по профилактике и борьбе со СПИД
680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2, (4212) 46-18-54
Е. А. Базыкина
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Россия
Россия
Базыкина Елена Анатольевна — м.н.с. лаборатории эпидемиологии и профилактики вирусных гепатитов и СПИДа
680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2, (4212) 46-18-55
О. А. Янович
ОГКУЗ «Центр профилактики и борьбы со СПИД»
Россия
Россия
Янович Ольга Александровна — главный врач
679016, ЕАО, Биробиджан, ул. Пионерская, 9, (42622) 2-33-40, 2-31-14
Ю. В. Щиканов
ОГКУЗ «Центр профилактики и борьбы со СПИД»
Россия
Россия
Щиканов Юрий Витальевич — зав. отделением профилактики, врач-эпидемиолог
679016, ЕАО, Биробиджан, ул. Пионерская, 9, (42622) 6-80-22, 2–31–14
М. Н. Павлова
ОГКУЗ «Центр профилактики и борьбы со СПИД»
Россия
Россия
Павлова Марина Николаевна — зав. лечебно-диагностическим отделом
679016, ЕАО, Биробиджан, ул. Пионерская, 9, (42 622) 4-12-70, 2-31-14
Т. И. Шмакова
ОГКУЗ «Центр профилактики и борьбы со СПИД»
Россия
Россия
Шмакова Тамара Ивановна — зав. лабораторным отделением
679016, ЕАО, Биробиджан, ул. Пионерская, 9, тел. (42622) 4-01-58
Список литературы
1. Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeter M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature. Infect. Genet. Evol., 2016, pp. 150-158.
2. Бобков А.Ф., Казеннова Е.В., Селимова Л.М., Ханина Т.А., Ладная Н.Н., Бобкова М.Р., Кравченко А.В., Рябов Г.С., Суханова А.Л., Буравцова Е.В., Покровский В.В., Weber J.N. Молекулярно-вирусологические особенности эпидемии ВИЧ-инфекции в России и других странах СНГ // Вестник Российской академии медицинских наук. 2003. № 12. С. 83-85. [Bobkov A.F., Kazennova E.V., Selimova L.M., Khanina T.A., Ladnaya N.N., Bobkova M.R., Kravchenko A.V., Ryabov G.S., Sukhanova A.L., Buravtsova E.V., Pokrobsky V.V., Weber J.N. The molecular-and-virological specificities of the HIV infection in Russia and other CIS countries. Bulletin of the Russian Academy of Medical Sciences, 2003, No. 12, pp. 83-85 (In Russ.)].
3. Бобкова М.Р. Генетическое разнообразие вирусов иммунодефицита человека и антиретровирусная терапия // Терапевтический архив. 2016. № 11. С. 103-111. [Bobkova M.R. Genetic diversity of human immunodeficiency viruses and antiretroviral therapy. Therapeutic Archive, 2016, No.11, pp. 103-111 (In Russ.)].
4. Суханова А.Л., Казеннова Е.В., Бобкова М.Р., Кравченко А.В., Селимова Л.М., Ханина Т.А., Бобков А.Ф., Покровский В.В. Варианты вируса иммунодефицита человека типа 1, обнаруживаемые в России среди инфицированных половым путем // Вопросы вирусологии. 2004. № 1. С. 4-7. [Sukhanova A. L, Kazennova E.V., Bobkova M.R., Kravchenko А.V., Selimova L.M., Khanina Т.А., Bobkov A.F., Pokrovsky V.V. Variations of human immunodeficiency virus, type 1 (HIV-1), detected in Russia among sexually infected individuals. Problems of Virology, 2004, No. 1, pp. 4-7 (In Russ.)].
5. Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. T. 3, № 4. C. 34-43. [Dement’eva N.Ye., Sizova N.V., Lisitsyna Z.N., Maklakova V.A., Krutitskaya L.I., Belyakov N.A. Analysis of HIV subtypes and dru-resistant variants circulating in Saint-Petersburg. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 4, pp. 34-43 (In Russ.)].
6. Богачев В.В., Тотменин А.В., Барышев П.Б., Мещерякова Ю.В., Черноусова Н.Я., Гашникова Н.М. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1 субтипов А и В, выделенных на территории Новосибирской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2012. № 6. С. 45-52. [Bogachev V.V., Totmenin A.V., Baryshev P.B., Mescheryakova Yu.V., Chernousova N.Ya., Gashnikova N.M. Molecular-genetic characteristic of HIV-1 A and В subtypes variants isolated in Novosibirsk region. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2012, No. 6, pp. 45-52 (In Russ.)].
7. Казеннова Е.В., Нешумаев Д.А., Рукавицин Д.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Ракчеева О.В., Васильева А.В., Туманов А.С., Воронцова Г.А., Кузнецова А.В., Лойфман Е.А., Старухина И.Н., Кустова О.И., Половица Н.В., Липская Н.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ эпидемии ВИЧ-инфекции в Благовещенске и Хабаровске (Дальний Восток России) // Вопросы вирусологии. 2014. Т. 59, № 4. С. 31-36. [Kazennova E.V., Neshumaev D.A., Rukavitsyn D.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Rakcheeva O.V., Vasilyevа A.V., Tumanov A.S., Vorontsova G.A., Kuznetsova A.V., Loyfman E.A., Staruchina I.N., Kustova O.I., Polovica N.V., Lipskaya N.A., Bobkova M.R. Molecular epidemiological analysis of the HIV infection in the Blagoveshchensk and Khabarovsk Area (Russian Far East). Virology Issues, 2014, Vol. 59, No. 4, pp. 31-36 (In Russ.)].
8. Казеннова Е.В., Лага В.Ю., Громов К.Б., Санков М.Н., Попова Е.С., Игумнова Е.Г., Опарина Е.Н., Сорокина Т.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ ВИЧ-инфекции в северных портовых городах России // Вопросы вирусологии. 2017. Т. 62, № 4. С. 154-161. [Kazennova E.V., Laga V.Yu., Gromov K.B., Sankov M.N., Popova E.S., Igumnova E.G., Oparina E.N., Sorokina T.A., Bobkova M.R. Molecular epidemiological analysis of HIV infection in Northern seaports of Russia. Virology Issues, 2017, Vol. 62, No. 4, pp. 154-161 (In Russ.)].
9. Казеннова Е.В., Васильев А.В. Лаповок И.А., Гришечкин А.Е., Лага В.Ю., Саламов Г.Г., Туманов А.С., Парыгина О.А., Рузаева Л.А., Грезина Л.А., Серкина Т.П., Кауфман О.А., Ооржак Н.Д., Лукашов В.В., Бобкова М.Р. Генетические варианты ВИЧ-1 в азиатской части России (2005-2010) // Вопросы вирусологии. 2013. Т. 58, № 4. С. 28-35. [Kazennova E.V., Vasilyev A.V., Lapovok I.A., Grishechkin A.E., Laga V.Yu., Salamov G.G., Tumanov A.S., Parygina O.V., Ruzaeva L.A., Grezina L.A., Serkina T.P., Kaufman O.A., Oordjak N.D., Lukashov V.V., Bobkova M.R. HIV-1 Genetic Variants in the Asian Part of Russia: a Study (2005-2010). Virology Issues, 2013, Vol. 58, No. 4, pp. 28-35 (In Russ.)].
10. Вазкез де Парга Е., Рахманова А.Г., Перез-Альварез Л., Виноградова А.Н., Дельгадо Е., Томсон М., Касадо Г., Сиерра М., Муньез М., Кармона Р., Вега И., Контерас Г., Медрано Л., Османов С., Нахера Р. Анализ мутаций, связанных с лекарственной резистентностью, у нелеченных пациентов, зараженных различными генетическими формами ВИЧ 1 типа, распространенными в странах бывшего Советского Союза // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2009. Т. 1, № 2. С. 50-56. [Vazquez de Parga E., Rakhmanova A.G., PerezAlvarez L., Vinogradova A.N., Delgado E., Thomson M., Casado G., Sierra M., Munoz M., Carmona R., Vega I., Contreras G., Medrano L., Osmanov S., Nahera R. Analysis of HIV-1 drug resistance-associated mutations in untreated individuals Infected with different HIV-1 strains prevalent in Fsu countries. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2009, Vol. 1, No. 2, pp. 50-56. (In Russ.)].
11. Туманов А.С., Казеннова Е.В., Громов К.Б., Ломакина Е.А., Зозуля Е.Ю., Берсенев П.Г., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ ВИЧ-инфекции в Сахалинской области // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2017. Т. 9, № 3. С. 113-120. [Tumanov A.S., Kazennova E.V., Gromov K.B., Lomakina E.A., Zozylya E.Yu., Bersenev P.G., Bobkova M.R. The Molecular epidemiological analysis of HIV infection in Sakhalin region, Russia. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2017, Vol. 9, No. 3, pp. 113-120. (In Russ.)].
12. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Васильев А.В., Лага В.Ю., Грезина Л.А., Волова Л.Ю. и др. Проблемы субтипирования ВИЧ-1на основе анализа гена pol и способы их разрешения // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2010. T. 3, № 2. C. 42-48. [Kazennova E.V., Lapovok I.A., Vasilyev A.V., Laga V.Yu., Grezina L.A., Volova L.Yu., Bobkova M.R. Problems of subtyping of HIV-1 on the base of Pol gene and ways of their permission. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2010, Vol. 3, No. 2, pp. 42-48. (In Russ.)].
13. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Mol. Biol. Evol., 2013,Vol. 30, No. 12, pp. 2725-2729.
14. Kazennova E., Laga V., Lapovok I., Glushchenko N., Neshumaev D., Vasilyev A. et al. HIV-1 Genetic Variants in the Russian Far East. AIDS Res. Hum. Retroviruses, 2014, Vol. 30, No. 8, pp. 742-752.
15. Thomson M.M., Vinogradova A., Delgado E., Rakhmanova A., Yakovlev A., Cuevas M.T., Munoz M., Pinilla M., Vega Y., Perez-Alvarez L., Osmanov S. and Najera R. Molecular Epidemiology of HIV-1 in St Petersburg, Russia: Predominance of Subtype A, Former Soviet Union Variant, and Identification of Intrasubtype Subclusters. J. Acquir. Immune Defic. Syndr., 2009, Vol. 51, No. 3, рр. 332-339.
16. Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR. AIDS Rev., 2013, Vol. 15, No. 4, pp. 204-212. PMID: 24192601.
17. Baryshev P.B., Bogachev V.V. Gashnikova N.M. Genetic characterization ofan isolate of HIV type 1 AG recombinant form circulating in Siberia, Russia. Arch. Virol., 2012, Vol. 157, No. 12, pp. 2335-2341.
18. Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек, 2014. 288с. [Bobkova M.R. Drug resistance of HIV. Moscow: Chelovek, 2014, 288 p. (In Russ)].
19. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лебедев А.В., Лага В.Ю., Глущенко Н.В., Зверев С.Я., Нистратова Ю.И., Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Герасимов В.В., Шошокин В.А., Бобкова М.Р. Анализ резистентности ВИЧ в Приволжском федеральном округе Российской Федерации // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. T. 7, № 3. С. 57-66. [Kazennova E.V., Lapovok I.A., Lebedev A.V., Laga V.Yu., Glushchenko N.V., Zverev S.Ya., Nistratova Yu.I., Zaytseva N.N., Parfenova O.V., Gerasimov V.V., Shoshokin V.A., Bobkova M.R. Analysis of HIV drugs resistance in Privolzhskiy federal district of the Russian Federation. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2015, Vol. 7, No. 3, pp. 57-66. (In Russ.)].
20. Youle M. Overview of boosted protease inhibition in treatment-experienced HIV-infected patients. J. Antimicrob. Chemother., 2007, Vol. 60, No. 6, pp. 1195-1205.
21. Беляева В.В., Кравченко А.В. Приверженность высокоактивной противоретровирусной терапии при ВИЧ-инфекции // Шаги профессионал. 2010. № 6. С. 12-21. [Belyaeva V.V., Kravchenko A.V. Adherence to highly active antiretroviral therapy for HIV infection. Shagi Professional, 2010, No. 6, pp. 12-21 (In Russ.)].
22. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ-1 IDU-A // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 4. С. 44-51. [Kazennova E.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Vasilyev A.V., Bobkova M.R. Natural polymorphisms of HIV-1 IDU-A variant pol gene. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 4, pp. 44-51 (In Russ)].
Рецензия
Для цитирования:
Котова В.О., Троценко О.Е., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А., Янович О.А., Щиканов Ю.В., Павлова М.Н., Шмакова Т.И. МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВАРИАНТОВ ВИЧ-1, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ЕВРЕЙСКОЙ АВТОНОМНОЙ ОБЛАСТИ. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2018;10(4):90-99. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2018-10-4-90-99
For citation:
Kotova V.O., Trotsenko O.E., Balakhontseva L.A., Bazykina E.A., Yanovich O.A., Schikanov Yu.V., Pavlova M.N., Shmakova T.I. MOLECULAR-EPIDEMIOLOGICAL CHARACTERISTICS OF HIV1 VARIANTS CIRCULATING IN THE JEWISH AUTONOMOUS REGION TERRITORY. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. 2018;10(4):90-99. (In Russ.) https://doi.org/10.22328/2077-9828-2018-10-4-90-99
Просмотров:
934
ISSN 2077-9828 (Print)
.png)
Послать статью по эл. почте 