МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ И ФАРМАКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ ВИЧ У ПАЦИЕНТОВ С ВИРУСОЛОГИЧЕСКОЙ НЕЭФФЕКТИВНОСТЬЮ АНТИРЕТРОВИРУСНОЙ ТЕРАПИИ В АРХАНГЕЛЬСКОЙ ОБЛАСТИ
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90
Аннотация
Введение. Эпидемия ВИЧ остается самой разрушительной в истории человечества, несмотря на комплексные профилактические мероприятия. Особое значение имеет фармакорезистентность ВИЧ к препаратам сразу нескольких групп, так как это значительно сокращает возможности терапии. Из-за низкой приверженности терапии некоторых категорий пациентов, а также возможности передачи фармакорезистентных ВИЧ в различных условиях лечение может не давать положительных результатов у 16–27% пациентов, не получавших АРВТ, и у 50–70% ранее лечившихся больных. Цель. Целью нашей работы было оценить молекулярно-эпидемиологическую структуру и фармакорезистентные варианты ВИЧ у пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельске. Материалы и методы. Для оценки молекулярно-эпидемиологической структуры и фармакорезистентных вариантов ВИЧ у 76 ВИЧинфицированных пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии из Архангельской области проводили анализ нуклеотидных последовательностей фрагмента гена полимеразы (pol) ВИЧ. Результаты. В обследованной группе преобладал ВИЧ генотипа A варианта А6 (IDU-A) (89,5%) по сравнению с генотипом В (9,2%), в одном случае (1,3%) выявлен вариант CRF03_AB. У 86,8% пациентов определена резистентность к каким-либо препаратам. Среди пациентов с выявленными мутациями фармакорезистентности показаны мутации устойчивости к ингибиторам протеазы у 33,3%, к ингибиторам обратной транскриптазы — у 92,4%. Образцы с фармакорезистентностью только к НИОТ составили 16,6%, к НеНИОТ 1,5%, к ИП 10,6%, одновременно к ИП и НИОТ 12,1%, к НИОТ и НеНИОТ 46,96%, ко всем трем группам препаратов одновременно — 12,1%. Наиболее распространены мутации лекарственной устойчивости к ламивудину и эмтрицитабину (M184V), невирапину и эфавирензу (K103N, G190S), аналогам тимидина (T215F/Y и/или K219Q/E и/или D67N) и нетимидиновым аналогам нуклеозидов (L74V).
Ключевые слова
Об авторах
Ю. В. Останкова
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Россия
Россия
кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14
А. Н. Щемелев
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Россия
Россия
младший научный сотрудник лаборатории вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции, аспирант
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14
Е. Б. Зуева
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Россия
Россия
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории экспериментальной вирусологии
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14
М. А. Чурина
Клиническая инфекционная больница им. С. П. Боткина
Россия
Россия
врач клинико-лабораторной диагностики лаборатории клинико-экспертной и экспресс-диагностики
195067, Санкт-Петербург, Пискаревский пр., д. 49
Д. Э. Валутите
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Россия
Россия
врач клинико-лабораторной диагностики отделения диагностики ВИЧ-инфекции и СПИД-ассоциированных заболеваний
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14
А. В. Семенов
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера,
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И. П. Павлова,
Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова
Россия
Россия
доктор биологических наук, заведующий лабораторией вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции, заместитель директора по инновационной работе; доцент кафедры иммунологии; доцент кафедры клинической лабораторной диагностики
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14
Список литературы
1. UNAIDS. Global HIV and AIDS statistics-2018 fact sheet [Online] 2018; Available from: http://www.unaids.org/en/resources/fact-sheet/. [Accessed 29 September 2018].
2. Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. Global and regional distribution of HIV-1 genetic subtypes and recombinants in 2004 // AIDS. 2006. Vol. 20. Р. W13–W23.
3. Hemelaar J. The origin and diversity of the HIV-1 pandemic // Trends Mol Med. 2012. Vol. 18 (3). P. 182–192.
4. Beloukas A., Psarris A., Giannelou P., Kostaki E., Hatzakis A., Paraskevis D. Molecular epidemiology of HIV-1 infection in Europe: An overview // Infect. Genet. Evol. 2016. Vol. 46. Р. 180–189. DOI: 10.1016/j.meegid.2016.06.033.
5. UNAIDS. Global AIDS Update 2016. 2016. Available from: http://www.unaids.org/en/resources/documents/2016/Global-AIDS-update-2016.
6. Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. 2013. Vol. 15. P. 204–212.
7. Справка Федерального научно-методического центра по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН Центрального НИ эпидемиологии Роспотребнадзора «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в первом полугодии 2019 г.».
8. Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeters M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review // Infect Genet Evol. 2016. Vol. 46. P. 150–158.
9. Niccolai L.M., Toussova O.V., Verevochkin S.V., Barbour R., Heimer R., Kozlov A.P. High HIV prevalence, suboptimal HIV testing, and low knowledge of HIV-positive serostatus among injection drug users in St. Petersburg, Russia // AIDS Behav. 2010. No. 14. P. 932–941.
10. Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р., Коломеец А.Н., Турбина Г.И., Шипулин Г.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. // Терапевтический архив. 2017. № 89 (11). С. 44–49.
11. Dukhovlinova E., Masharsky A., Toussova O., Verevochkin S., Solovyeva T., Meringof M., Paintsil E., White E., Barbour R., Heimer R., Kozlov A. Two Independent HIV Epidemics in St. Petersburg, Russia Revealed by Molecular Epidemiology // AIDS Research and Human Retroviruses. 2015. Vol. 31 (6). P. 608–614.
12. Казеннова Е.В., Нешумаев Д.А., Руковицин Д.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Ракчеева О.В., Васильев А.В., Туманов А.С., Воронцова Г.А., Кузнецова А.В., Лойфман Е.А., Старухина И.Н., Кустова О.И., Половица Н.В., Липская Н.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ эпидемии ВИЧ-инфекции в Благовещенске и Хабаровске (Дальний Восток России) // Вопросы вирусологии. 2014. № 4. С. 31–36.
13. Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. Т. 3. № 4. C. 34–44.
14. De Mendoza C. Hot News: HIV Epidemics — Current Burden and Future Prospects // AIDS Rev. 2017. Vol. 19 (4). P. 239.
15. Scherrer A., von Wyl V., Yan W., Emergence of Acquired HIV-1 Drug Resistance Almost Stopped in Switzerland: A 15-Year Prospective Cohort Analysis // Clin. Infect. Dis. 2016. Vol. 15. No. 62 (10). P. 1310–1317.
16. Gupta R.K., Jordan M.R., Sultan B.J., Hill A., Davis D.H., Gregson J., Sawyer A.W., Hamers R.L., Ndembi N., Pillay D., Bertagnolio S. Global trends in antiretroviral resistance in treatment-naive individuals with HIV after rollout of antiretroviral treatment in resource-limited settings: a global collaborative study and meta-regression analysis // Lancet. 2012. Vol. 380. P. 1250–1258.
17. Pasquet A., Messou E., Gabillard D., Minga A., Depoulosky A., Deuffic-Burban S., Losina E., Freedberg K.A., Danel C., Anglaret X., Yazdanpanah Y. Impact of drug stock-outs on death and retention to care among HIV-infected patients on combination antiretroviral therapy in Abidjan. Cote d’Ivoire // PLoS One. 2010. Vol. 5. e13414.
18. Hirsch M.S., Günthard H.F., Schapiro J.M., Brun-Vézinet F., Clotet B., Hammer S.M., Johnson V.A., Kuritzkes D.R., Mellors J.W., Pillay D., Yeni P.G., Jacobsen D.M., Richman D.D. Antiretroviral drug resistance testing in adult HIV-1 infection: 2008 recommendations of an international AIDS society — USA panel // Clin. Infect. Dis. 2008. Vol. 47 (2). Р. 266–285. doi: 10.1086/589297.
19. Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets // Mol. Biol. Evol. 2016. No. 33 (7). P. 1870–1874.
20. Попова Е.С., Сорокина Т.А. Информационный бюллетень центра по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями Государственного автономного учреждения здравоохранения Архангельской области «Архангельский клинический кожно-венерологический диспансер». Архангельск, 2018. № 1 (38). Режим доступа: 16.08.2019 http://www.kotlasgb.ru/news/1331/?sphrase_id=951
21. http://www.kotlasgb.ru/for_patients/profilact/2017%20%D0%B3%D0%BE%D0%B4%20%D0%98%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%BC%20%D0%B1%D1%8E%D0%BB%D0%BB%D0%B5%D1%82%D0%B5%D0%BD%D1%8C.doc
22. Kazennova E., Laga V., Lapovok I., Glushchenko N., Neshumaev D., Vasilyev A., Bobkova M. HIV-1 Genetic Variants in the Russian Far East // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2014. No. 8. P. 742–752.
23. Choudinovskikh O., Denissenko M. Migration Between CIS Countries: Trends and Policy. Search Working Paper (January). WP3/06. Available from: http://www.ub.edu/searchproject/wp-content/uploads/2013/02/WP_3_6.pdf
24. Aibekova L., Foley B., Hortelano G., Raees M., Abdraimov S., Toichuev R., Ali S. Molecular epidemiology of HIV-1 subtype A in former Soviet Union countries // PLoS One. 2018. No. 13 (2). e0191891.
25. Бородкина О.И. Проблемы профилактики ВИЧ/СПИДа среди международных мигрантов // Социальное обслуживание семей и детей: научно-методический сборник. 2016. № 8. С. 102–109.
26. Софронов А.Г., Добровольская А.Е., Пашковский В.Э., Чащин В.П., Чащин М.В., Зуева Л.П., Асланов Б.И., Гончаров А.Е. Распространенность социально-значимых инфекционных заболеваний у трудовых мигрантов в Санкт-Петербурге // Медицинский академический журнал. 2014. № 14 (4). С. 79–83.
27. Казеннова Е.В., Лага В.Ю., Громов К.Б., Санков М.Н., Попова Е.С., Игумнова Е.Г., Опарина Е.Н., Сорокина Т.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ ВИЧ-инфекции в северных портовых городах России // Вопросы вирусологии. 2017. Т. 62. № 4. С. 154–161.
28. Кравченко А.В. Современные схемы антиретровирусной терапии // Медицинский совет. 2016. № 17. С. 84–89.
Рецензия
Для цитирования:
Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В. МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ И ФАРМАКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ ВИЧ У ПАЦИЕНТОВ С ВИРУСОЛОГИЧЕСКОЙ НЕЭФФЕКТИВНОСТЬЮ АНТИРЕТРОВИРУСНОЙ ТЕРАПИИ В АРХАНГЕЛЬСКОЙ ОБЛАСТИ. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2019;11(4):79-90. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90
For citation:
Ostankova Yu.V., Schemelev A.N., Zueva E.V., Churina M.A., Valutite D.E., Semenov A.V. HIV MOLECULAR EPIDEMIOLOGY AND PHARMACO-RESISTANCE IN PATIENTS WITH ANTIRETROVIRAL THERAPY FAILURE IN ARKHANGELSK DISTRICT. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. 2019;11(4):79-90. (In Russ.) https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90
Просмотров: 673
.png)
Послать статью по эл. почте 