Использование метода филогенетического анализа при проведении эпидемиологического расследования случая заражения ВИЧ-инфекцией в педиатрической практике
С. П. Кругляк,
В. О. Котова,
Е. И. Мирошниченко,
О. А. Скалий,
Е. С. Махно,
Т. В. Гришкевич, 
Л. Ф. Скляр,
С. Н. Бениова,
О. М. Григорян,
Л. А. Балахонцева,
О. Е. Троценко
Л. Ф. Скляр,
С. Н. Бениова,
О. М. Григорян,
Л. А. Балахонцева,
О. Е. Троценко https://doi.org/10.22328/2077-9828-2021-13-1-106-114
Аннотация
Целью исследования было изучение основных путей и факторов риска инфицирования ребенка ВИЧ, установление вероятного источника его инфицирования, а также исключение возможности криминального или нозокомиального заражения.
Материалы и методы. На первом этапе выполнялось эпидемиологическое расследование. Затем проводился молекулярно-генетический анализ двух исследуемых образцов плазмы крови (ребенка и матери) и группы сравнения с использованием 18 нуклеотидных последовательностей вариантов ВИЧ-1, полученных от пациентов, проживающих в Приморском крае, и 8 охарактеризованных нуклеотидных последовательностей, дополнительно взятых из международной базы данных GenBank. Расчет дистанций и филогенетический анализ выполняли путем построения филогенетических деревьев методом Maximum Likelihood с использованием модели эволюции GTR.
Результаты исследований. Полученные данные свидетельствуют, что нуклеотидная последовательность, полученная от ребенка, наиболее сходна с нуклеотидной последовательностью, полученной от матери (потенциального источника), они достоверно группируются на филогенетическом дереве, образуя общий кластер, отличный от образцов группы сравнения. Это свидетельствует о вероятности наличия эпидемиологической связи между случаями ВИЧ-инфекции у матери и ее ребенка.
Заключение. По результатам данного исследования можно сделать вывод о заражении ребенка от ВИЧ-инфицированной матери, ориентировочно в возрасте старше 4 лет, когда у него был получен последний отрицательный результат тестирования на маркеры ВИЧ.
Об авторах
С. П. Кругляк
Краевая клиническая больница № 2, Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями
Россия
Россия
Кругляк Светлана Петровна — кандидат медицинских наук, заведующий лабораторным отделением
690000, Владивосток, ул. Борисенко, д. 50
В. О. Котова
Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии
Россия
Россия
Котова Валерия Олеговна — заведующий лабораторией эпидемиологии и профилактики вирусных гепатитов и СПИДа
680610, Хабаровск, ул. Шевченко, д. 2
SPIN-код: 5424–8491
Е. И. Мирошниченко
Краевая клиническая больница № 2, Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями
Россия
Россия
Елена Ивановна — заведующий отделом эпидемиологического надзора
690000, Владивосток, ул. Борисенко, д. 50
О. А. Скалий
Краевая клиническая больница № 2, Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями
Россия
Россия
Скалий Ольга Артуровна — врач-педиатр
690000, Владивосток, ул. Борисенко, д. 50
Е. С. Махно
Краевая клиническая больница № 2, Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями
Россия
Россия
Махно Екатерина Савельевна — врач-лаборант
690000, Владивосток, ул. Борисенко, д. 50
Т. В. Гришкевич
Краевая клиническая больница № 2, Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями
Россия
Россия
Гришкевич Татьяна Владиславовна — врач-эпидемиолог отдела эпидемиологического надзора
690000, Владивосток, ул. Борисенко, д. 50
Л. Ф. Скляр
Краевая клиническая больница № 2, Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями; Дальневосточный федеральный университет, Школа биомедицины
Россия
Россия
Скляр Лидия Федоровна — доктор медицинских наук, заместитель главного врача; профессор
690000, Владивосток, ул. Борисенко, д. 50
690091, Приморский край, г. Владивосток, ул. Суханова, д. 8
SPIN-код: 7001–8975
С. Н. Бениова
Краевая клиническая больница № 2, Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями; Дальневосточный федеральный университет, Школа биомедицины
Россия
Россия
Бениова Светлана Николаевна — доктор медицинских наук, профессор, главный врач; профессор
690105, Владивосток, ул. Русская, д. 55
690091, Приморский край, г. Владивосток, ул. Суханова, д. 8
SPIN-код: 9715–7742
О. М. Григорян
Краевая клиническая больница № 2, Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями; Дальневосточный федеральный университет, Школа биомедицины
Россия
Россия
Григорян Ованнес Мнацаканович — врач ультразвуковой диагностики; аспирант
690000, Владивосток, ул. Борисенко, д. 50
690091, Приморский край, г. Владивосток, ул. Суханова, д. 8
SPIN-код: 3102–2994
Л. А. Балахонцева
Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии
Россия
Россия
Балахонцева Людмила Анатольевна — руководитель Дальневосточного окружного центра по профилактике и борьбе со СПИД
680610, Хабаровск, ул. Шевченко, д. 2
SPIN-код: 6061–0551
О. Е. Троценко
Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии
Россия
Россия
Троценко Ольга Евгеньевна — доктор медицинских наук, директор
680610, Хабаровск, ул. Шевченко, д. 2
SPIN-код: 1088–8195
Список литературы
1. Женщина, ребенок и ВИЧ / под ред. Н.А.Белякова, Н.Ю.Рахманиной, А.Г.Рахмановой. СПб.: Балтийский медицинский образовательный центр, 2012. 600 с.
2. Оказание помощи женщинам и детям с ВИЧ-инфекцией: медицинский тематический архив / под ред. Н.А.Белякова, А.В.Самариной. СПб.: Балтийский медицинский образовательный центр, 2013. № 3. 166 с.
3. Лопатухин А., Ладная Н., Кириллова Н., Киреев Д., Никотина Л., Щепинова О., Коннова Т. Применение методов генотипирования ВИЧ и филогенетического анализа при эпидемиологическом расследовании // Врач. 2015. № 2. С. 2–5.
4. Abecasis A.B., Pingarilho M., Vandamme A.M. Phylogenetic analysis as a forensic tool in HIV transmission investigations // AIDS. 2018. Vol. 32. No. 5. Р. 543–554.
5. Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Поляков А.Н., Букин Е.К., Kaiser R., Luebke N., Куевда Д.А., Шипулин Г.А. Первый опыт применения стандартизированной генотипической методики определения тропизма ВИЧ // Клиническая лабораторная диагностика. 2013. № 6. C. 46–48.
6. Лага В.Ю., Казеннова Е.В., Васильев А.В., Лаповок И.А., Исмаилова А., Бейшеева Н., Асыбалиева Н., Бобкова М.Р. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, распространенных на территории Киргизии // Вопросы вирусологии. 2012. Т. 57, № 5. С. 26–32.
7. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0 // Mol. Biol. Evol. 2013. Vol. 30, No. 12. Р. 2725–2729.
8. Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Куевда Д.А. Возможности молекулярных методов при проведении эпидемиологического расследования случаев ВИЧ-инфекции // Материалы X съезда Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. М., 2012. С. 417–418.
Рецензия
Для цитирования:
Кругляк С.П., Котова В.О., Мирошниченко Е.И., Скалий О.А., Махно Е.С., Гришкевич Т.В., Скляр Л.Ф., Бениова С.Н., Григорян О.М., Балахонцева Л.А., Троценко О.Е. Использование метода филогенетического анализа при проведении эпидемиологического расследования случая заражения ВИЧ-инфекцией в педиатрической практике. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2021;13(1):106-114. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2021-13-1-106-114
For citation:
Kruglyak S.P., Kotova V.O., Miroshnichenko E.I., Skaly O.A., Makhno E.S., Grishkevich T.V., Sklyar L.F., Beniova S.N., Grigorian O.M., Balakhontseva L.A., Trotsenko O.E. Use of the method of phylogenetic analysis in an epidemiological investigation in case of HIV infection in pediatric practice. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. 2021;13(1):106-114. (In Russ.) https://doi.org/10.22328/2077-9828-2021-13-1-106-114
Просмотров:
795
.png)
Послать статью по эл. почте 