Preview

ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии

Расширенный поиск

ТОЧНОСТЬ ОПРЕДЕЛЕНИЯ СУБТИПА ВИЧ-1 НА ОСНОВАНИИ АНАЛИЗА НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ V3 ПЕТЛИ ГЕНА gp120

https://doi.org/10.22328/2077-9828-2015-7-1-40-44

Об авторах

Марина Юрьевна Дмитрюкова
Центральный НИИ Эпидемиологии
Россия


Дмитрий Евгеньевич Киреев
Центральный НИИ Эпидемиологии
Россия


Алексей Эдуардович Лопатухин
Центральный НИИ Эпидемиологии
Россия


Илья Андреевич Лаповок
Центральный НИИ Эпидемиологии
Россия


Герман Александрович Шипулин
Центральный НИИ Эпидемиологии
Россия


Список литературы

1. Global report: UNAIDS Report on global AIDS epidemic 2013 / WHO Library Cataloguing-in-Publication Data. - Geneva: UNAIDS, 2013. - 198 р.

2. Покровский В.В., Ладная Н.Н., Соколова Е.В., Буравцова Е.В. ВИЧ-инфекция: Информационный бюллетень № 38. - М.: Федеральный научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом, 2013. - 53 с. - URL: http://hivrussia.ru/files/bul_38.pdf (дата обращения 07.07.2014) г.

3. HIV DATABASES. - URL: www.hiv.lanl.gov (дата обращения 5.06.2014).

4. Hemelaar J. Implications of HIV diversity for the HIV-1 pandemic // Journal of Infections. - 2013. - Vol. 66. - P. 391-400.

5. Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. - 2013. - Vol. 15. - P. 204-212.

6. Santoro M.M., Perno C.F. HIV-1 genetic variability and clinical implication // ISRN Microbioilogy. - 2013. - 2013. - Р. 481314, doi: 10.1155/2013/481314.

7. de Oliveira T., Deforche K., Cassol S., Salminen M., Paraskevis D., Seebregts C., Snoeck J., van Rensburg E.J., Wensing A.M., van de Vijver D.A., Boucher C.A., Camacho R., Vandamme A.M. An automated genotyping system for analysis of HIV-1 and other microbial sequences // Bioinformatics. - 2005. - Vol. 21 (19). - p. 3797-3800.

8. Lengauer T. Bioinformatical assistance of selecting anti-HIV therapies: where do we stand? // Intervirology. - 2012. - Vol. 55. - P. 108-112.

9. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0 // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - Vol. 30. - P. 2725-2729.

10. Lengauer T., Sander O., Sierra S., Thielen A., Kaiser R. Bioinformatics prediction of HIV coreceptor usage // Nat Biotechnol. - 2007. - Vol. 25. - P. 1407-1410.

11. Liitsola K., Holm K., Bobkov A., Pokrovsky V., Smolskaya T., Leinikki P., Osmanov S., Salminen M. An AB recombinant and its parental HIV type 1 strains in the area of the former Soviet Union: low requirements for sequence identity in recombination. UNAIDS Virus Isolation Network // AIDS Res. Hum. Retroviruses. - 2000. - Vol. 16 (11). - P. 1047-1053.

12. Yebra G., Mulder M., Martin L., Perez-Cachafeiro S., Rodriguez C., Labarga P. Sensitivity of seven HIV subtyping tools differs among subtypes/recombinants in the Spanish cohort of naïve HIV-infected patients (CoRIS) // Antiviral Res. - 2011. - Vol. 89. - P. 19-25.

13. Snoeck J.I., Kantor R., Shafer R.W., Van Laethem K., Deforche K., Carvalho A.P. Discordances between interpretation algorithms for genotypic resistance to protease and reverse transcriptase inhibitors of human immunodeficiency virus are subtype dependent // Antimicrob Agents Chemother. - 2006. - Vol. 50. - P. 694-701.

14. Struck D., Lawyer G., Ternes A.M., Schmit J.C., Perez Bercoff D. COMET: adaptive context-based modeling for ultrafast HIV-1 subtype identification// Nucleic Acids Research 2014. doi 10.1093/nar/gku739.


Рецензия

Для цитирования:


Дмитрюкова М.Ю., Киреев Д.Е., Лопатухин А.Э., Лаповок И.А., Шипулин Г.А. ТОЧНОСТЬ ОПРЕДЕЛЕНИЯ СУБТИПА ВИЧ-1 НА ОСНОВАНИИ АНАЛИЗА НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ V3 ПЕТЛИ ГЕНА gp120. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015;7(1):40-44. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2015-7-1-40-44

For citation:


Dmitryukova M.Y., Kireev D.E., Lopatukhin A.E., Lapovok I.A., Shipulin G.A. ACCURACY OF HIV-1 SUBTYPE ASSIGNMENT OF V3 LOOP GP120 GENE. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. 2015;7(1):40-44. (In Russ.) https://doi.org/10.22328/2077-9828-2015-7-1-40-44

Просмотров: 539


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2077-9828 (Print)