Длительность вирусовыделения SARS-CoV-2 у больных COVID-19 с сопутствующей ВИЧ-инфекцией

Цель исследования: охарактеризовать продолжительность вирусовыделения SARS-CoV-2 у больных ВИЧ-инфекцией и выявить факторы, ассоциированные с длительным вирусовыделением.

Материалы и методы. В проспективном исследовании у 170 больных COVID-19 с сопутствующей ВИЧ-инфекцией сопоставлены клинико-лабораторные характеристики течения COVID-19 и ВИЧ-инфекции и длительность вирусовыделения SARS-CoV-2, у 68 пациентов определены титры вируснейтрализующих антител к SARS-CoV-2, у 36 пациентов выполнено генотипирование возбудителя. Статистическая обработка результатов проведена с использованием пакета IBM SPSS Statistics.

Результаты и их обсуждение. Показано отсутствие достоверных различий длительности вирусовыделения SARS-CoV-2 у больных с разной степенью тяжести COVID-19; выявлена отрицательная связь величины титра вируснейтрализующих антител к SARS-CoV-2 с длительностью вирусовыделения. У 35,9% пациентов (61 человек) персистенция вируса продолжалась более 21 дня, данная группа характеризовалась неблагоприятным течением ВИЧ-инфекции в отсутствие антиретровирусной терапии (АРТ), достоверно более низкими значениями CD4-лимфоцитов и более высокой вирусной нагрузкой ВИЧ в крови. Продемонстрировано достоверно более длительное вирусовыделение для варианта В.1.1 по сравнению с другими геновариантами SARS-CoV-2. В гене Spike-белка у 4 больных выявлены мутации, повышающие инфицирующую способность возбудителя и снижающие чувствительность патогена к действию нейтрализующих антител.

Заключение. Тяжесть COVID-19 не влияла на длительность вирусовыделения SARS-CoV-2 у больных ВИЧ-инфекцией. Длительная персистенция вируса выявлена у пациентов с выраженным иммунодефицитом (CD4<200 кл/мкл) в отсутствие АРТ. Больные с длительным вирусовыделением представляют эпидемиологический риск в отношении формирования новых мутационных вариантов возбудителя.

1. Greninger A.L., Rybkina K., Lin M.J. et al. Human parainfluenza virus evolution during lung infection of immunocompromised individuals pro-motes viral persistence // J. Clin. Invest. 2021. Dec 1. Vol. 131, No. 23. Р. e150506. doi: 10.1172/JCI150506.

2. Lehners N., Tabatabai J., Prifert C. et al. Long-Term Shedding of Influenza Virus, Parainfluenza Virus, Respiratory Syncytial Virus and Nosocomial Epidemiology in Patients with Hematological Disorders // PLoS One. 2016. Feb 11. Vol. 11, No. 2. Р. e0148258. doi: 10.1371/journal.pone.0148258.

3. Ison M.G., Gubareva L.V., Atmar R.L., Treanor J., Hayden F.G. Recovery of drug-resistant influenza virus from immunocompromised patients: a case series // J. Infect. Dis. 2006. Mar. 15. Vol. 193, No. 6. Р. 760–764. doi: 10.1086/500465.

4. Memoli M.J., Athota R., Reed S. et al. The natural history of influenza infection in the severely immunocompromised vs nonimmunocompromised hosts // Clin. Infect. Dis. 2014. Jan. Vol. 58, No. 2. Р. 214–224. doi: 10.1093/cid/cit725.

5. Zhou F., Yu T., Du R. et al. Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study // Lancet. 2020. Mar. 28. Vol. 395, No. 10229. Р. 1054–1062. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30566-3.

6. Young B.E., Ong S.W.X., Kalimuddin S. et al. Singapore 2019 Novel Coronavirus Outbreak Research Team. Epidemiologic Features and Clinical Course of Patients Infected With SARS-CoV-2 in Singapore // JAMA. 2020. Apr 21. Vol. 323, Nо. 15. Р. 1488–1494. doi: 10.1001/jama.2020.3204.

7. Cevik M., Tate M., Lloyd O. et al. SARS-CoV-2, SARS-CoV, and MERS-CoV viral load dynamics, duration of viral shedding, and infectiousness: a systematic review and meta-analysis // Lancet Microbe. 2021. Jan; Vol. 2, No. 1. Р. e13-e22. doi: 10.1016/S2666-5247(20)30172-5.

8. Van Kampen J.J.A., van de Vijver D.A.M.C., Fraaij P.L.A. et al. Duration and key determinants of infectious virus shedding in hospitalized patients with coronavirus disease-2019 (COVID-19) // Nat. Commun. 2021. Jan 11. Vol. 12, No. 1. Р. 267. doi: 10.1038/s41467-020-20568-4.

9. Rahmani A., Dini G., Leso V. et al. Duration of SARS-CoV-2 shedding and infectivity in the working age population: a systematic review and meta-analysis // Med. Lav. 2022. Apr 26. Vol. 113, No. 2. Р. e2022014. doi: 10.23749/mdl.v113i2.12724.

10. Chen C.F., Tsai T.Y., Yu C.H., Cheng H.L., Yeh T.Y. Prolonged viral shedding and new mutations of COVID-19 could complicate the control of the pandemic // Access Microbiol. 2020. May 27. Vol. 2, No. 7. Р. acmi000133. doi: 10.1099/acmi.0.000133.

11. Avanzato V.A., Matson M.J., Seifert S.N. et al. Case Study: Prolonged Infectious SARS-CoV-2 Shedding from an Asymptomatic Immunocompromised Individual with Cancer // Cell. 2020. Dec 23. Vol. 183, No. 7. Р. 1901–1912. e9. doi: 10.1016/j.cell.2020.10.049.

12. Wang M., Luo L., Bu H., Xia H. One case of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in a patient co-infected by HIV with a low CD4+ T-cell count // Int. J. Infect. Dis. 2020. Jul. Vol. 96. Р. 148–150. doi: 10.1016/j.ijid.2020.04.06.

13. Sepulcri C., Dentone C., Mikulska M. et al. The Longest Persistence of Viable SARS-CoV-2 With Recurrence of Viremia and Relapsing Symptomatic COVID-19 in an Immunocompromised Patient-A Case Study // Open Forum Infect Dis. 2021. Apr. 28. Vol. 8, No. 11. Р. ofab217. doi: 10.1093/ofid/ofab217.

14. Corey L., Beyrer C., Cohen M.S. et al. SARS-CoV-2 Variants in Patients with Immunosuppression // N. Engl. J. Med. 2021. Aug 5. Vol. 385, No. 6. Р. 562–566. doi: 10.1056/NEJMsb2104756.

15. Vizcarra P., Pérez-Elías M.J., Quereda C. et al. COVID-19 ID Team. Description of COVID-19 in HIV-infected individuals: a single-centre, prospective cohort // Lancet HIV. 2020. Aug. Vol. 7, No. 8. Р. e554-e564. doi: 10.1016/S2352–3018(20)30164–8.

16. Huang J., Xie N., Hu X. et al. Epidemiological, Virological and Serological Features of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Cases in People Living With Human Immunodeficiency Virus in Wuhan: A Population-based Cohort Study // Clin. Infect. Dis. 2021. Oct 5. Vol. 73, No. 7. Р. e2086-e2094. doi: 10.1093/cid/ciaa1186.

17. Leung W.F., Chorlton S., Tyson J. et al. COVID-19 in an immunocompromised host: persistent shedding of viable SARS-CoV-2 and emergence of multiple mutations: a case report // Int. J. Infect. Dis. 2022 Jan. Vol. 114. Р. 178–182. doi: 10.1016/j.ijid.2021.10.045.

18. Stanevich O.V., Alekseeva E.I., Sergeeva M. et al. SARS-CoV-2 escape from cytotoxic T cells during long-term COVID-19 // Nat. Commun. 2023. Jan 10. Vol. 14, No. 1. Р. 149. doi: 10.1038/s41467-022-34033-x

19. Cele S., Karim F., Lustig G. et al. SARS-CoV-2 prolonged infection during advanced HIV disease evolves extensive immune escape // Cell Host. Microbe. 2022. Feb 9. Vol. 30, No. 2. Р. 154–162. e5. doi: 10.1016/j.chom.2022.01.005.

20. Weigang S., Fuchs J., Zimmer G. et al. Within-host evolution of SARS-CoV-2 in an immunosuppressed COVID-19 patient as a source of immune escape variants // Nat. Commun. 2021. Nov. 4. Vol. 12, No. 1. Р. 6405. doi: 10.1038/s41467-021-26602-3.

21. Rana R., Kant R., Huirem R.S., Bohra D., Ganguly N.K. Omicron variant: Current insights and future directions // Microbiol. Res. 2022. Dec. Vol. 265. Р. 127204. doi: 10.1016/j.micres.2022.127204.

22. Tarcsai K.R., Corolciuc O., Tordai A., Ongrádi J. SARS-CoV-2 infection in HIV-infected patients: potential role in the high mutational load of the Omicron variant emerging in South Africa // Geroscience. 2022. Oct. Vol. 44, No. 5. Р. 2337–2345. doi: 10.1007/s11357-022-00603-6.

23. Bansal N., Raturi M., Bansal Y. SARS-CoV-2 variants in immunocompromised COVID-19 patients: The underlying causes and the way forward // Transfus Clin. Biol. 2022. May. Vol. 29, No. 2. Р. 161–163. doi: 10.1016/j.tracli.2021.12.006.

24. Goes L.R., Siqueira J.D., Garrido M.M. et al. Evidence of recurrent selection of mutations commonly found in SARS-CoV-2 variants of concern in viruses infecting immunocompromised patients // Front Microbiol. 2022. Jul. 26. Vol. 13. Р. 946549. doi: 10.3389/fmicb.2022.946549.

25. Memoli M.J., Athota R., Reed S. et al. The natural history of influenza infection in the severely immunocompromised vs nonimmunocompromised hosts // Clin. Infect. Dis. 2014. Jan. Vol. 58, No. 2. Р. 214–224. doi: 10.1093/cid/cit725.

26. Ahmadi A.S., Zadheidar S., Sadeghi K. et al. SARS-CoV-2 intrahost evolution in immunocompromised patients in comparison with immunocom-petent populations after treatment // J. Med. Virol. 2023. Jun. Vol. 95, No. 6. Р. e28877. doi: 10.1002/jmv.28877.