МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ВАРИАНТОВ ВИЧ-1, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В РЕСПУБЛИКЕ КРЫМ

Введение. Анализ генетических вариантов в республике Крым до настоящего времени ограничивался исследованием 2006 года. Распространенность ВИЧ-инфекции на полуострове на 20% выше, чем в среднем по России, при этом 80% случаев инфекции связаны с половым способом передачи. Кроме того, перебои с поставками лекарственных препаратов с 2014 года создают условия для активного появления лекарственно устойчивых штаммов ВИЧ. Цель: изучение молекулярно-генетических вариантов ВИЧ, циркулировавших на территории Республики Крым в 2017–2018 гг. Материалы и методы. Проведен анализ генотипа последовательностей фрагмента гена pol ВИЧ-1, полученных от 84 инфицированных пациентов, наблюдающихся в Центре профилактики и борьбы со СПИДом Республики Крым. Результаты. Соотношение генетических вариантов ВИЧ-1 в исследованной выборке отражает молекулярно-эпидемиологическую ситуацию в России и Украине, характеризующуюся доминированием суб-субтипа А6 (97,6%); также выявлено по одному образцу вирусов подтипа B и рекомбинантной формы AG, уникальной по последовательности гена pol. Cреди анализированных последовательностей от «наивных» пациентов не отмечено случаев резистентности ВИЧ. У большинства АРВТ-пациентов с неуспехом терапии выявлена множественная лекарственная устойчивость, при этом лидирующую по встречаемости позицию занимала замена M184V, второй по частоте была замена K103N. У 39 из 55 АРВТ-пациентов замена схем терапии производилась по причине отсутствия препаратов на складе.

ВИЧ-инфекция, молекулярная эпидемиология, лекарственная устойчивость, Республика Крым, антиретровирусная терапия

1. Bobkov A.F., Kazennova E.V., Selimova L.M. et al. Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: predominance of subtype A // J. Med. Virol. 2004. Vol. 74. Nо. 2. Р. 191–196.

2. Thomson M.M., de Parga E.V., Vinogradova A. et al. New insights into the origin of the HIV type 1 subtype A epidemic in former Soviet Union’s countries derived from sequence analyses of preepidemically transmitted viruses // AIDS Res Hum Retroviruses. 2007. Vol. 23. Nо. 12. Р. 1599–1604.

3. Bobkov A., Kazennova E., Selimova L. et al. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: identification of subtype A, subtype B, and novel gagA/envB recombinants // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998. Vol. 14. Nо. 8. Р. 669–676.

4. Kazennova E., Laga V., Lapovok I. et al. HIV-1 genetic variants in the Russian Far East // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2014. Vol. 30. Nо. 8. Р. 742–752.

5. Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. 2013. Vol. 15. Nо. 4. Р. 204–212.

6. Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. HIV-1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia // AIDS Res Hum Retroviruses. 2014. Vol. 30. Nо. 6. Р. 592–597.

7. Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. // Терапевтический архив. 2017. Т. 89. № 11. С. 43–48

8. Saad M.D., Shcherbinskaya A.M., Nadai Y. et al. Molecular epidemiology of HIV Type 1 in Ukraine: birthplace of an epidemic // AIDS Res Hum Retroviruses. 2006. Vol. 22. Nо 8. Р. 709–714.

9. Nabatov A.А., Kravchenko O.N., Lyulchuk M.G. et al. Simultaneous introduction of HIV type 1 subtype A and B viruses into injecting drug users in southern Ukraine at the beginning of the epidemic in the former Soviet Union // AIDS Res Hum Retroviruses. 2002. Vol. 18. Nо. 12. Р. 891–895.

10. Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D. et al. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review // Infect. Genet. Evol. 2016. Vol. 46. Р. 150–158.

11. Carr J.K., Nadai Y., Eyzaguirre L. et al. Outbreak of a West African recombinant of HIV-1 in Tashkent, Uzbekistan // J. Acquir Immune Defic. Syndr. 2005. Vol. 39. Nо. 5. Р. 570–575.

12. Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. Genetic characterization of an isolate of HIV type 1 AG recombinant form circulating in Siberia, Russia // Arch. Virol. 2012. Vol. 157, Nо. 12. Р. 2335–2341.

13. Vasylyeva T.I., Liulchuk M., du Plessis L. et al. The Changing Epidemiological Profile of HIV-1 Subtype B Epidemic in Ukraine // AIDS Res Hum Retroviruses. 2019. Vol. 35, Nо 2. Р. 155–163.

14. Роспотребнадзор, Справка «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2018 г.»

15. Dumchev K., Sazonova Y., Salyuk T. et al. Trends in HIV prevalence among people injecting drugs, men having sex with men, and female sex workers in Ukraine // Int. J. STD AIDS. 2018. Vol. 29, Nо. 13. Р. 1337–1344.

16. Роспотребнадзор. Справка «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2017 г.»

17. В Крыму заболеваемость ВИЧ растет стремительными темпами. 2018; Available from: https://ruinformer.com/page/v-krymu-zabolevaemost-vich-rastet-stremitelnymi-tempami

18. Kazatchkine M. Russia’s ban on methadone for drug users in Crimea will worsen the HIV/AIDS epidemic and risk public health // BMJ. 2014. Vol. 348. Р. 3118.

19. Лага В.Ю., Казеннова Е.В., Васильев А.В. и др. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, распространенных на территории Киргизии // Вопросы вирусологии. 2012. № 5. С. 26–31.

20. Gianotti N., Galli L., Boeri E. et al. In vivo dynamics of the K103N mutation following the withdrawal of non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors in Human Immunodeficiency Virus-infected patients // New Microbiol. 2005. Vol. 28. Nо. 4. Р. 319–326.