Анализ некоторых полиморфных вариантов гена IFNAR1 у ВИЧ-инфицированных лиц

Целью нашей работы было изучение генотипического и аллельного распределения некоторых полиморфных вариантов гена IFNAR1 у ВИЧ-инфицированных лиц и оценка ассоциации выявленных вариантов с ВИЧ-инфекцией.

Материалы и методы. Материалом для исследования послужили образцы цельной крови, полученные от ВИЧ-инфицированных лиц с вирусологической неэффективностью применяемой антиретровирусной терапии (n=378) и практически здоровых лиц (n=319). Осуществляли секвенирование всех экзонов гена IFNAR1 с частичным охватом фланкирующих интронных последовательностей, включая анализ промоторного участка и значительного по протяженности интронного сегмента в области, предшествующей промотору, с последующим анализом полученных нуклеотидных последовательностей.

Результаты и их обсуждение. Показана статистически значимая связь с ВИЧ-инфекцией трех полиморфных вариантов гена IFNAR1: rs2843710 (–654 C/G), rs2257167 (4 экзон, 18339G>C: Val168Leu), rs2856973 (10 интрон, 28767 A>T). Распределение генотипов всех исследуемых полиморфных вариантов в анализируемых группах соответствовало равновесию Харди–Вайнберга. Показано достоверное отличие в распределении генотипов между ВИЧ-инфицированными лицами и  контрольной группой: rs2843710  — х ²=9,624 при p=0,0081, rs2257167  — х²=8,623 при p=0,0134, rs2856973 — х²=10,447 при p=0,0054. Показана ассоциация гомозиготного генотипа C/C и минорного аллеля C локуса rs2257167 с предрасположенностью к ВИЧ-инфекции, в то время как генотипы G/G (rs2843710) и T/T (rs2856973) вместе с соответствующими аллелями G и T проявляют выраженный протективный эффект.

Заключение. Настоящее исследование раскрывает взаимосвязь между полиморфизмом гена IFNAR1 и предрасположенностью к ВИЧ-инфекции, демонстрируя его значимую, но не исключительную роль в развитии заболевания.

1. Global HIV & AIDS statistics — Fact sheet / UNAIDS 2024 epidemiological estimates. Available from: https://www.unaids.org/en/resources/factsheet (access date: 14.08.2025).

2. McMyn N.F., Varriale J., Fray E.J., Zitzmann C., MacLeod H., Lai J., Singhal A., Moskovljevic M., Garcia M.A., Lopez B.M., Hariharan V., Rhodehouse K., Lynn K., Tebas P., Mounzer K., Montaner L.J., Benko E., Kovacs C., Hoh R., Simonetti F.R., Laird G.M., Deeks S.G., Ribeiro R.M., Perelson A.S., Siliciano R.F., Siliciano J.M. The latent reservoir of inducible, infectious HIV-1 does not decrease despite decades of antiretroviral therapy // J. Clin. Invest. 2023. Vol. 133, No. 17. Р. e171554. doi: 10.1172/JCI171554.

3. Schemelev A.N., Davydenko V.S., Ostankova Y.V., Reingardt D.E., Serikova E.N., Zueva E.B., Totolian A.A. Involvement of Human Cellular Proteins and Structures in Realization of the HIV Life Cycle: A Comprehensive Review, 2024 // Viruses. 2024. Vol. 16. Р. 1682. https://doi.org/10.3390/v16111682.

4. Ivanov S., Lagunin A., Filimonov D., Tarasova O. Network-based analysis of OMICs data to understand the HIV-host interaction // Front. Microbiol. 2020. Vol. 11. Р. 1314. doi: 10.3389/fmicb.2020.01314.

5. Hendricks C.M., Cordeiro T., Gomes A.P., Stevenson M. The Interplay of HIV-1 and Macrophages in Viral Persistence // Front Microbiol. 2021. Vol. 12. Р. 646447. doi: 10.3389/fmicb.2021.646447.

6. Delannoy A., Poirier M., Bell B. Cat and Mouse: HIV Transcription in Latency, Immune Evasion and Cure/Remission Strategies // Viruses. 2019. Vol. 11, No. 3. Р. 269. doi: 10.3390/v11030269.

7. Balasubramaniam M., Pandhare J., Dash C. Immune Control of HIV // J. Life Sci. (Westlake Village). 2019. Vol. 1, No. 1. Р. 4–37. URL: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6714987/

8. Swiecki M., Colonna M. Type I interferons: diversity of sources, production pathways and effects on immune responses // Curr. Opin Virol. 2011. Vol. 1, No. 6. Р. 463–475. doi: 10.1016/j.coviro.2011.10.026.

9. Ali S., Mann-Nüttel R., Schulze A., Richter L., Alferink J., Scheu S. Sources of Type I Interferons in Infectious Immunity: Plasmacytoid Dendritic Cells Not Always in the Driver’s Seat // Front Immunol. 2019. Vol. 10. Р. 778. doi: 10.3389/fimmu.2019.00778.

10. Nguyen N.V., Tran J.T., Sanchez D.J. HIV blocks Type I IFN signaling through disruption of STAT1 phosphorylation // Innate Immun. 2018. Vol. 24, No. 8. Р. 490–500. doi: 10.1177/1753425918803674.

11. Wang Y., Qian G., Zhu L., Zhao Z., Liu Y., Han W., Zhang X., Zhang Y., Xiong T., Zeng H., Yu X., Yu X., Zhang X., Xu J., Zou Q., Yan D. HIV-1 Vif suppresses antiviral immunity by targeting STING // Cell Mol Immunol. 2022. Vol. 19, No. 1. Р. 108–121. doi: 10.1038/s41423-021-00802-9.

12. Останкова Ю.В., Серикова Е.Н., Ануфриева Е.В., Басина В.В., Машков И.А., Ширшова Н.Ю., Кусевицкая М.Б., Горская О.А., Тотолян А.А. Прогностическая оценка развития гепатоцеллюлярной карциномы на основе определения полиморфизма гена человека IFNAR-1 и/или его экспрессии // Клиническая лабораторная диагностика. 2024. Т. 69, № 7. С. 349–357. doi: 10.51620/0869-2084-2024-69-7-349-357.

13. Diop G., Hirtzig T., Do H., Coulonges C., Vasilescu A., Labib T., Spadoni J.L., Therwath A., Lathrop M., Matsuda F., Zagury J.F. Exhaustive genotyping of the interferon alpha receptor 1 (IFNAR1) gene and association of an IFNAR1 protein variant with AIDS progression or susceptibility to HIV-1 infection in a French AIDS cohort // Biomed Pharmacother. 2006. Vol. 60, No. 9. Р. 569–577. doi: 10.1016/j.biopha.2006.08.002.

14. Salanti G., Amountza G., Ntzani E.E., Ioannidis J.P. Hardy-Weinberg equilibrium in genetic association studies: an empirical evaluation of reporting, deviations, and power // Eur. J. Hum. Genet. 2005. Vol. 13, No. 7. Р. 840–848. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201410.

15. Pekkoc-Uyanik K.C., Todurga-Seven Z.G., Shahzadi A., Sonmez H., Mercan S., Mete B., Tabak F. Next-generation sequencing of CCR5, CXCR4, and IFNAR1 variants in relation to HIV-1 disease progression and ART response // Sci. Rep. 2025. Vol. 15, No. 1. Р. 26511. doi: 10.1038/s41598-025-11843-9.

16. Mhandire D.Z., Mhandire K., Magadze M., Wonkam A., Kengne A.P., Dandara C. Genetic variation in toll like receptors 2, 7, 9 and interleukin6 is associated with cytomegalovirus infection in late pregnancy // BMC Med. Genet. 2020. Vol. 21, No. 1. Р. 113. doi: 10.1186/s12881-020-01044-8.

17. Zou R., Zhang G., Li S., Wang W., Yuan J., Li J., Wang Y., Lin Y., Deng Y., Zhou B., Gao G.F., Liu Y. A functional polymorphism in IFNAR1 gene is associated with susceptibility and severity of HFMD with EV71 infection // Sci Rep. 2015. Vol. 5. Р. 18541. doi: 10.1038/srep18541.

18. Cheng L., Yu H., Li G., Li F., Ma J., Li J., Chi L., Zhang L., Su L. Type I interferons suppress viral replication but contribute to T cell depletion and dysfunction during chronic HIV-1 infection // JCI Insight. 2017. Vol. 2, No. 12. e94366. doi: 10.1172/jci.insight.94366. 1

19. Singh H., Ojeda-Juárez D., Maung R., Shah R., Roberts A.J., Kaul M. A pivotal role for Interferon-a receptor-1 in neuronal injury induced by HIV-1 // J. Neuroinflammation. 2020. Vol. 17, No. 1. Р. 226. doi: 10.1186/s12974-020-01894-2.