Изменения флоры кишечника в зависимости от стадии ВИЧ-инфекции, вирусной нагрузки и количества СD4-клеток

Целью работы является установление закономерностей изменения таксономического состава и функциональной активности кишечной микробиоты в зависимости от клинической стадии ВИЧ-инфекции, уровня вирусной нагрузки и количества CD4-лимфоцитов с определением прогностических маркеров прогрессирования заболевания. Материалы и методы. Проведено проспективное когортное исследование с участием 347 пациентов с верифицированной ВИЧ-инфекцией и 78 здоровых добровольцев в период с января 2021 по декабрь 2023 г. Таксономический анализ микробиоты выполнялся методом высокопроизводительного секвенирования вариабельных регионов V3–V4 гена 16S рРНК на платформе Illumina MiSeq с определением вирусной нагрузки методом ПЦР и подсчетом CD4-лимфоцитов проточной цитометрией. Результаты и их обсуждение. Выявлено прогрессивное снижение микробного богатства по мере утяжеления ВИЧ-инфекции с уменьшением индекса Шеннона с 4,12±0,34 в контроле до 1,94±0,29 при терминальной стадии. Установлена сильная отрицательная корреляция между разнообразием микробиоты и вирусной нагрузкой, положительная корреляция с количеством CD4-клеток. Относительная представленность Proteobacteria возросла с 8,1% до 41,7%, тогда как доля Firmicutes снизилась с 68,4% до 34,2% при прогрессировании заболевания. Заключение. Прогрессирование ВИЧ-инфекции закономерно сопровождается формированием выраженного дисбиоза с критическим снижением микробного разнообразия при уровне CD4-клеток менее 200/мкл, что позволяет использовать микробиологические параметры как дополнительные прогностические биомаркеры течения заболевания

1. Скоповец Е.Я., Белевцев М.В. Изменения микробиома кишечника при первичных иммунодефицитах: обзор современных данных // Лабораторная диагностика. Восточная Европа. 2022. Т. 11, № 3. С. 349–362. doi: 10.34883/PI.2022.11.3.010. EDN ZEFWFK.

2. Goloshchapov O.V., Chukhlovin A.B., Glotov O.S. Possible role of intestinal human viruses and bacteriophages following hematopoietic stem cell transplantation: a mini-review // Cellular Therapy and Transplantation. 2021. Vol. 10, No. 4. P. 19–25. doi: 10.18620/ctt-1866-8836-2021-10-3-4-19-25. EDN CWOJBR.

3. Хасанова Г.М., Урунова Д.М., Ахмеджанова З.И., Гиясова Г.М., Черникова А.А., Хасанова А.Н. Поражение желудочно-кишечного тракта при ВИЧ-инфекции // Пермский медицинский журнал. 2019. № 3. С. 24–28. doi: 10.17238/PmJ1609-1175.2019.3.24-28.

4. Хасанова Г.Р., Биккинина О.И., Анохин В.А., Аниховская И.А., Яковлев М.Ю. Кишечный фактор прогрессирования ВИЧ-инфекции // Успехи современной биологии. 2020. Т. 140, № 3. С. 278–288. doi: 10.31857/S0042132420030059.

5. Altin K.H. Alteration of Gut microbiota during HIV infection // Bioengineering Studies. 2023. Vol. 4, No. 1. P. 9–15. doi: 10.37868/bes.v4i1.id247.

6. Guillo L., Uzzan M., Beaugerie L. et al. Impact of HIV Infection on the Course of Inflammatory Bowel Disease and Drug Safety Profile: A Multicenter GETAID Study // Clinical Gastroenterology and Hepatology. 2022. Vol. 20, Issue 4. P. 787–797. doi: 10.1016/j.cgh.2020.12.023.

7. Новикова В.П., Полунина А.В. Состав кишечной микробиоты при COVID-инфекции (научный обзор) // Профилактическая и клиническая медицина. 2020. № 4 (77). С. 81–86. doi: 10.47843/2074-9120_2020_4_81.

8. Asowata O.E., Singh A., Ngoepe A. et al. Irreversible depletion of intestinal CD4 T cells is associated with T cell activation during chronic HIV infection // JCI Insight. 2021. Vol. 6, No. 22. P. 1–18. doi: 10.1172/jci.insight.146162.

9. Crakes K.R., Jiang G. Gut Microbiome Alterations During HIV/SIV Infection: Implications for HIV Cure // Frontiers in Microbiology. 2019. Vol. 10. P. 1–10. doi: 10.3389/fmicb.2019.01104.

10. Козорез Е.И., Стома И.О. Кишечный микробиом у ВИЧ-инфицированных пациентов // Клиническая инфектология и паразитология. 2024. Т. 13, № 3. С. 348–358. doi: 10.34883/PI.2024.13.3.037. EDN HVPLCK.

11. Narayanan A., Kieri O., Vesterbacka J. et al. Exploring the interplay between antiretroviral therapy and the gut-oral microbiome axis in people liv ing with HIV // Sci Rep. 2024. Vol. 14. Р. 17820. https://doi.org/10.1038/s41598-024-68479-4.