Preview

ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии

Расширенный поиск

ЦИРКУЛИРУЮЩАЯ РЕКОМБИНАНТНАЯ ФОРМА ВИРУСА ГЕПАТИТА С RF2k/1b: ПРОБЛЕМЫ ДИАГНОСТИКИ И ТЕРАПИИ

https://doi.org/10.22328/2077-9828-2016-8-1-42-52

Полный текст:

Аннотация

Цель исследования: установить причину «нестандартных» результатов при генотипировании вируса гепатита С (ВГС) с применением тест-системы «Abbott RealTime HCV Genotype II». Материалы и методы исследования: 19 образцов плазмы крови коинфицированных ВГС/ВИЧ пациентов с «нестандартными» результатами генотипирования ВГС были исследованы путем секвенирования областей генома ВГС NS5B и 5’UTR/core, а также с применением генотипирующих наборов производства «Вектор-Бест» и «Интерлабсервис». Результаты: установлено, что обследованные пациенты инфицированы RF2k/1b ВГС. Среди коинфицированных ВИЧ/ВГС доля инфицированных RF2k/1b составляет 6%. Заключение: широко применяемые в рутинной практике тест-системы, мишенью которых является только один фрагмент генома вируса 5’UTR/core, ошибочно идентифицируют рекомбинант ВГС RF2k/1b как генотип 2. Данные о результатах противовирусной терапии у пациентов, инфицированных RF2k/1b, говорят о недостаточной эффективности схем, рекомендованных для лечения вируса генотипа 2.

Об авторах

Наталья Евгеньевна Дементьева
Санкт-Петербургский центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями; Институт экспериментальной медицины
Россия


Ольга Викторовна Калинина
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия


Ольга Олеговна Знойко
Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И.Евдокимова Минздрава России
Россия


Николай Алексеевич Беляков
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П.Павлова; Институт экспериментальной медицины; НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера Северо-Западный окружной центр по профилактике и борьбе со СПИД
Россия


Анатолий Борисович Жебрун
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия


Список литературы

1. Моисеев С.В. Лечение хронического гепатита С: результаты рандомизированных контролируемых исследований // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии.- 2010.- Т. 2, № 4.- С. 91-97.

2. Кижло С.Н., Романова С.Ю. Сочетание противовирусной терапии хронического вирусного гепатита и ВИЧ-инфекции // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии.- 2011.- Т. 3, № 3.- С. 88-93.

3. Гущин А.Е., Носкова О.М., Шипулин Г.А. Разработка набора реагентов «Амплисенс HCV-генотип» для определения субтипов 1а, 1b, 2а, 3а вируса гепатита С // Вопросы вирусологии.- 2003.- Т. 48, № 3.- С. 45-48.

4. Миронов К.О., Гущин А.Е., Шипулина О.Ю., Шипулин Г.А. Разработка и клиническая апробация тест-системы «Амплисенс HCV-1/2/3» // Сборник трудов 6-й Всероссийской науч.-практ. конф. «Молекулярная диагностика-2007».- М., 2007.- Т. 1.- С. 260-265.

5. Ведерников В.Е., Иванов М.К., Трухина А.В., Кандрушин Е.В. Два новых диагностических набора: «РеалБест РНК ВГС» и «РеалБест РНК ВГС-генотип» // Информационный бюллетень «Новости «Вектор-Бест».- 2009.- Т. 52, № 2.- С. 2-8.

6. Martell M., Esteban J.I., Quer J., Genesca J., Weiner A., Esteban R., Guardia J., Gomez J. Hepatitis C virus (HCV) circulates as a population of different but closely related genomes: quasispecies nature of HCV genome distribution // J. Virol.- 1992.- Vol. 66, № 5.- P 3225-3229.

7. Smith D.B., Bukh J., Kuiken C., Muerhoff A.S., Rice C.M., Stapleton J.T., Simmonds P. Expanded classification of hepatitis C virus into 7 genotypes and 67 subtypes: updated criteria and genotype assignment web resource // Hepatology.- 2014.- Vol. 59, № 1.- P 318-327.

8. Kalinina O., Norder H., Mukomolov S., Magnius L.O. A natural intergenotypic recombinant of hepatitis C virus identified in St. Petersburg // J. Virol.- 2002.- Vol. 76, № 8.- P 4034-4043.

9. Simmonds P., Bukh J., Combet C., Deleage G., Enomoto N., Feinstone S., Halfon P., Inchauspe G., Kuiken C., Maertens G., Mizokami M., Murphy D.G., Okamoto H., Pawlotsky J.M., Penin F., Sablon E., Shin-IT., Stuyver L.J., Thiel H.J., Viazov S., Weiner A.J., Widell A. Consensus proposals for a unified system of nomenclature of hepatitis C virus genotypes // Hepatology.- 2005.- Vol. 42, № 4.- P 962-973.

10. Lee Y.M., Lin H.J., Chen Y.J., Lee C.M., Wang S.F., Chang K.Y., Chen T.L., Liu H.F., Chen Y.M. Molecular epidemiology of HCV genotypes among injection drug users in Taiwan: Full-length sequences of two new subtype 6w strains and a recombinant form_2b6w // J. Med. Virol.- 2010.- Vol. 82, № 1.- P 57-68.

11. Legrand-Abravanel F., Claudinon J., Nicot F., Dubois M., Chapuy-Regaud S., Sandres-Saune K., Pasquier C., Izopet J. New natural intergenotypic (2/5) recombinant of hepatitis C virus // J. Virol.- 2007.- Vol. 81, № 8.- P 4357-4362.

12. Noppornpanth S., Lien T.X., Poovorawan Y., Smits S.L., Osterhaus A.D., Haagmans B.L. Identification of a naturally occurring recombinant genotype 2/6 hepatitis C virus // J. Virol.- 2006.- Vol. 80, № 15.- P 7569-7577.

13. Bhattacharya D., Accola M.A., Ansari I.H., Striker R., Rehrauer W.M. Naturally occurring genotype 2b/1a hepatitis C virus in the United States // J. Virol.- 2011.- Vol. 8.- P 458.

14. Yokoyama K., Takahashi M., Nishizawa T., Nagashima S., Jirintai S., Yotsumoto S., Okamoto H., Momoi M.Y. Identification and characterization of a natural inter-genotypic (2b/1b) recombinant hepatitis C virus in Japan // Arch. Virol.- 2011.- Vol. 156, № 9.- P 1591-1601.

15. Kageyama S., Agdamag D.M., Alesna E.T., Leano P.S., Heredia A.M., Abellanosa-Tac-An I.P., Jereza L.D., Tanimoto T., Yamamura J., Ichimura H. A natural inter-genotypic (2b/1b) recombinant of hepatitis C virus in the Philippines // J. Med. Virol.- 2006.- Vol. 78, № 11.- P. 1423-1428.

16. Kalinina O., Jern C., Tallo T., Thcakharian V., Gusev D., Znoiko O., Isaguliants M., Mukomolov S., Norder H., Magnius L. Spread of the natural hepatitis C virus recombinant outside Russia // 12th International symposium on viral hepatitis and liver disease.- Paris, 2006.- P 189.

17. Kurbanov F., Tanaka Y., Avazova D., Khan A., Sugauchi F., Kan N., Kurbanova-Khudayberganova D., Khikmatullaeva A., Musabaev E., Mizokami M. Detection of hepatitis C virus natural recombinant RF1_2k/1b strain among intravenous drug users in Uzbekistan // Hepatol. Res. - 2008.- Vol. 38, № 5.- P. 457-464.

18. Moreau I., Hegarty S., Levis J., Sheehy P., Crosbie O., Kenny-Walsh E., Fanning L.J. Serendipitous identification of natural intergenotypic recombinants of hepatitis C in Ireland // J. Virol.- 2006.- Vol. 3.- P. 95.

19. Tallo T., Norder H., Tefanova V., Krispin T., Schmidt J., Ilmoja M., Orgulas K., Pruunsild K., Priimagi L., Magnius L.O. Genetic characterization of hepatitis C virus strains in Estonia: fluctuations in the predominating subtype with time // J. Med. Virol.- 2007.- Vol. 79, № 4.- P 374-382.

20. Demetriou V.L., Kyriakou E., Kostrikis L.G. Near-full genome characterisation of two natural intergenotypic 2k/1b recombinant hepatitis C virus isolates // Adv Virol. - 2011.- Vol. 2011.- P. 710438.

21. Morel V., Descamps V., Francois C., Fournier C., Brochot E., Capron D., Duverlie G., Castelain S. Emergence of a genomic variant of the recombinant 2k/1b strain during a mixed Hepatitis C infection: a case report // J. Clin. Virol.- 2010.- Vol. 47, № 4.- P. 382-386.

22. Karchava M., Waldenstrom J., Parker M., Hallack R., Sharvadze L., Gatserelia L., Chkhartishvili N., Dvali N., Dzigua L., Dolmazashvili E., Norder H., Tsertsvadze T. High incidence of the hepatitis C virus recombinant 2k/1b in Georgia: Recommendations for testing and treatment // Hepatol. Res.- 2015.

23. Raghwani J., ThomasX.V., Koekkoek S.M., Schinkel J., Molenkamp R., van de Laar T.J., Takebe Y., Tanaka Y., Mizokami M., Rambaut A., Pybus O.G. Origin and evolution of the unique hepatitis C virus circulating recombinant form 2k/1b // J. Virol.- 2012.- Vol. 86, № 4.- P 2212-2220.

24. Nakatani S.M., Santos C.A., Riediger I.N., Krieger M.A., Duarte C.A., do Carmo Debur M., Carrilho FJ., Ono S.K. Comparative performance evaluation of hepatitis C virus genotyping based on the 5’ untranslated region versus partial sequencing of the NS5B region of brazilian patients with chronic hepatitis C // J. Virol.- 2011.- Vol. 8.- P. 459.

25. Cai Q., Zhao Z., Liu Y., Shao X., Gao Z. Comparison of three different HCV genotyping methods: core, NS5B sequence analysis and line probe assay // Int. J. Mol. Med.- 2013.- Vol. 31, № 2.- P 347-352.

26. Larrat S., Poveda J.D., Coudret C., Fusillier K., Magnat N., Signori-Schmuck A., Thibault V., Morand P. Sequencing assays for failed genotyping with the versant hepatitis C virus genotype assay (LiPA), version 2.0 // J. Clin. Microbiol.- 2013.- Vol. 51, № 9.- P 2815-2821.

27. Quer J., Gregori J., Rodriguez-Frias F., Viladomiu L., Salmeron J., Ruiz-Extremera A., Quiles-Perez R., Moreno-Otero R., Lopez-Rodriguez R., Allende H., Romero-Gomez M., Guardia J., Esteban R., Garcia-Samaniego J., Forns X., Esteban J.I. High-resolution hepatitis C virus subtyping using NS5B deep sequencing and phylogeny, an alternative to current methods // J. Clin. Microbiol.- 2015.- Vol. 53, № 1.- P 219-226.

28. McCormick A.L., Macartney M.J., Abdi-Abshir I., Labbett W., Smith C., Irish D., Webster D.P., Haque T. Evaluation of sequencing of HCV core/E1, NS5A and NS5B as a genotype predictive tool in comparison with commercial assays targeting 5’UTR // J. Clin. Virol.- 2015.- Vol. 66.- P. 56-59.

29. Liu C.H., Liang C.C., Liu C.J., Lin C.L., Su T.H., Yang H.C., Chen P.J., Chen D.S., Kao J.H. Comparison of Abbott RealTime HCV Genotype II with Versant line probe assay 2.0 for hepatitis C virus genotyping // J. Clin. Microbiol.- 2015.- Vol. 53, № 5.- P. 1754-1757.

30. Vaghefi P., MarchadierE., Dussaix E., Roque-Afonso A.M. Hepatitis C virus genotyping: comparison of the Abbott RealTime HCV Genotype II assay and NS5B sequencing // Pathol. Biol.- 2010.- Vol. 58, № 2 - P. 175-178.

31. Gonzalez V., Gomes-Fernandes M., Bascunana E., Casanovas S., Saludes V., Jordana-Lluch E., Matas L., Ausina V., Martro E. Accuracy of a commercially available assay for HCV genotyping and subtyping in the clinical practice // J. Clin. Virol.- 2013.- Sep.- Vol. 58, № 1.- P 249-253.

32. Калинина О.В. Организация генома и география природного межгенотипного рекомбинанта вируса гепатита С RF1_2k/1b // Инфекция и иммунитет.- 2012.- Т. 2, № 4.- С. 677-686.

33. Николаева Л.И., Сапронов Г.В., Колотвин А.В., Самохвалов Е.И., Лейбман Е.А., Самоходская Л.М. Гепатит С при инфицировании рекомбинантной формой вируса RF2k/1b: течение и терапия // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2014. - № 3. - С. 9-15.

34. Калинина О.В., Дудина К.Р., Козина А.Н., Дмитриев А.В., Исагулянц М.Г., Знойко О.О. Межгенотипные рекомбинанты вируса гепатита С - природные модели для изучения молекулярно-генетических детерминант резистентности вируса к действию противовирусных препаратов // Трансляционная медицина.- 2014.- № 3.- С. 29-38.

35. European Association for the Study of the Liver. EASL recommendations on treatment of hepatitis C 2015 // Journal of Hepatology.- 2015.- Vol. 63.- P. 199-236.

36. Кравченко А.В., Куимова У.А., Ганкина Н.Ю., Канестри В.Г., Чуланов В.П. Предикторы устойчивого вирусологического ответа при терапии хронического гепатита пегилированным интерфероном и рибавирином у больных ВИЧ-инфекцией // Инфекционные болезни.- 2014.- Т. 12, № 2.- С. 30-34.

37. Hedskog C., Doehle B., Chodavarapu K., Gontcharova V., Crespo Garcia J., De Knegt R., Drenth J.P., McHutchison J.G., Brainard D., Stamm L.M., Miller M.D., Svarovskaia E., Mo H. Characterization of hepatitis C virus intergenotypic recombinant strains and associated virological response to sofosbuvir/ribavirin // Hepatology.- 2015.- Vol. 61, № 2.- P 471-480.


Для цитирования:


Дементьева Н.Е., Калинина О.В., Знойко О.О., Беляков Н.А., Жебрун А.Б. ЦИРКУЛИРУЮЩАЯ РЕКОМБИНАНТНАЯ ФОРМА ВИРУСА ГЕПАТИТА С RF2k/1b: ПРОБЛЕМЫ ДИАГНОСТИКИ И ТЕРАПИИ. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2016;8(1):42-52. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2016-8-1-42-52

For citation:


Dementyeva N.Y., Kalinina O.V., Znoyko O.O., Belyakov N.A., Zhebrun A.B. THE CIRCULATING RECOMBINANT FORM RF2k/1b OF HEPATITIS C VIRUS: PROBLEMS IN DIAGNOSTICS AND THERAPY. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. 2016;8(1):42-52. (In Russ.) https://doi.org/10.22328/2077-9828-2016-8-1-42-52

Просмотров: 499


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2077-9828 (Print)