Preview

ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии

Расширенный поиск

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ВАРИАНТОВ ВИЧ-1, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В РЕСПУБЛИКЕ КРЫМ

https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-91-97

Полный текст:

Аннотация

Введение. Анализ генетических вариантов в республике Крым до настоящего времени ограничивался исследованием 2006 года. Распространенность ВИЧ-инфекции на полуострове на 20% выше, чем в среднем по России, при этом 80% случаев инфекции связаны с половым способом передачи. Кроме того, перебои с поставками лекарственных препаратов с 2014 года создают условия для активного появления лекарственно устойчивых штаммов ВИЧ. Цель: изучение молекулярно-генетических вариантов ВИЧ, циркулировавших на территории Республики Крым в 2017–2018 гг. Материалы и методы. Проведен анализ генотипа последовательностей фрагмента гена pol ВИЧ-1, полученных от 84 инфицированных пациентов, наблюдающихся в Центре профилактики и борьбы со СПИДом Республики Крым. Результаты. Соотношение генетических вариантов ВИЧ-1 в исследованной выборке отражает молекулярно-эпидемиологическую ситуацию в России и Украине, характеризующуюся доминированием суб-субтипа А6 (97,6%); также выявлено по одному образцу вирусов подтипа B и рекомбинантной формы AG, уникальной по последовательности гена pol. Cреди анализированных последовательностей от «наивных» пациентов не отмечено случаев резистентности ВИЧ. У большинства АРВТ-пациентов с неуспехом терапии выявлена множественная лекарственная устойчивость, при этом лидирующую по встречаемости позицию занимала замена M184V, второй по частоте была замена K103N. У 39 из 55 АРВТ-пациентов замена схем терапии производилась по причине отсутствия препаратов на складе.

Об авторах

В. Ю. Лага
Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н. Ф. Гамалеи Минздрава России
Россия

кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов

123098, г. Москва, ул. Гамалеи, д. 16



А. В. Немыкин
Центр профилактики и борьбы со СПИДом
Россия

главный врач государственного бюджетного учреждения здравоохранения Республики Крым

295000, г. Симферополь, ул. Александра Невского, д. 27А 



Е. Н. Бегма
Центр профилактики и борьбы со СПИДом
Россия

заведующая клинико-диагностической лабораторией государственного бюджетного учреждения здравоохранения Республики Крым

295000, г. Симферополь, ул. Александра Невского, д. 27А



А. М. Страхова
Центр профилактики и борьбы со СПИДом
Россия
врач-эпидемиолог  

295000, г. Симферополь, ул. Александра Невского, д. 27А


Н. А. Васильева
Центр профилактики и борьбы со СПИДом
Россия

биолог клинико-диагностической лаборатории государственного бюджетного учреждения здравоохранения Республики Крым

295000, г. Симферополь, ул. Александра Невского, д. 27А

spidcentr.epid@yandex.ru



Е. Н. Ожмегова
Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н. Ф. Гамалеи Минздрава России
Россия

младший научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов

123098, г. Москва, ул. Гамалеи, д. 16



А. А. Антонова
Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н. Ф. Гамалеи Минздрава России
Россия

младший научный сотрудник лаборатории вирусов лейкозов

123098, г. Москва, ул. Гамалеи, д. 16



М. Р. Бобкова
Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н. Ф. Гамалеи Минздрава России
Россия

доктор биологических наук, заведующая лабораторией вирусов лейкозов

123098, г. Москва, ул. Гамалеи, д. 16



Список литературы

1. Bobkov A.F., Kazennova E.V., Selimova L.M. et al. Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: predominance of subtype A // J. Med. Virol. 2004. Vol. 74. Nо. 2. Р. 191–196.

2. Thomson M.M., de Parga E.V., Vinogradova A. et al. New insights into the origin of the HIV type 1 subtype A epidemic in former Soviet Union’s countries derived from sequence analyses of preepidemically transmitted viruses // AIDS Res Hum Retroviruses. 2007. Vol. 23. Nо. 12. Р. 1599–1604.

3. Bobkov A., Kazennova E., Selimova L. et al. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: identification of subtype A, subtype B, and novel gagA/envB recombinants // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998. Vol. 14. Nо. 8. Р. 669–676.

4. Kazennova E., Laga V., Lapovok I. et al. HIV-1 genetic variants in the Russian Far East // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2014. Vol. 30. Nо. 8. Р. 742–752.

5. Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. 2013. Vol. 15. Nо. 4. Р. 204–212.

6. Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. HIV-1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia // AIDS Res Hum Retroviruses. 2014. Vol. 30. Nо. 6. Р. 592–597.

7. Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. // Терапевтический архив. 2017. Т. 89. № 11. С. 43–48

8. Saad M.D., Shcherbinskaya A.M., Nadai Y. et al. Molecular epidemiology of HIV Type 1 in Ukraine: birthplace of an epidemic // AIDS Res Hum Retroviruses. 2006. Vol. 22. Nо 8. Р. 709–714.

9. Nabatov A.А., Kravchenko O.N., Lyulchuk M.G. et al. Simultaneous introduction of HIV type 1 subtype A and B viruses into injecting drug users in southern Ukraine at the beginning of the epidemic in the former Soviet Union // AIDS Res Hum Retroviruses. 2002. Vol. 18. Nо. 12. Р. 891–895.

10. Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D. et al. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review // Infect. Genet. Evol. 2016. Vol. 46. Р. 150–158.

11. Carr J.K., Nadai Y., Eyzaguirre L. et al. Outbreak of a West African recombinant of HIV-1 in Tashkent, Uzbekistan // J. Acquir Immune Defic. Syndr. 2005. Vol. 39. Nо. 5. Р. 570–575.

12. Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. Genetic characterization of an isolate of HIV type 1 AG recombinant form circulating in Siberia, Russia // Arch. Virol. 2012. Vol. 157, Nо. 12. Р. 2335–2341.

13. Vasylyeva T.I., Liulchuk M., du Plessis L. et al. The Changing Epidemiological Profile of HIV-1 Subtype B Epidemic in Ukraine // AIDS Res Hum Retroviruses. 2019. Vol. 35, Nо 2. Р. 155–163.

14. Роспотребнадзор, Справка «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2018 г.»

15. Dumchev K., Sazonova Y., Salyuk T. et al. Trends in HIV prevalence among people injecting drugs, men having sex with men, and female sex workers in Ukraine // Int. J. STD AIDS. 2018. Vol. 29, Nо. 13. Р. 1337–1344.

16. Роспотребнадзор. Справка «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2017 г.»

17. В Крыму заболеваемость ВИЧ растет стремительными темпами. 2018; Available from: https://ruinformer.com/page/v-krymu-zabolevaemost-vich-rastet-stremitelnymi-tempami

18. Kazatchkine M. Russia’s ban on methadone for drug users in Crimea will worsen the HIV/AIDS epidemic and risk public health // BMJ. 2014. Vol. 348. Р. 3118.

19. Лага В.Ю., Казеннова Е.В., Васильев А.В. и др. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, распространенных на территории Киргизии // Вопросы вирусологии. 2012. № 5. С. 26–31.

20. Gianotti N., Galli L., Boeri E. et al. In vivo dynamics of the K103N mutation following the withdrawal of non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors in Human Immunodeficiency Virus-infected patients // New Microbiol. 2005. Vol. 28. Nо. 4. Р. 319–326.


Для цитирования:


Лага В.Ю., Немыкин А.В., Бегма Е.Н., Страхова А.М., Васильева Н.А., Ожмегова Е.Н., Антонова А.А., Бобкова М.Р. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ВАРИАНТОВ ВИЧ-1, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В РЕСПУБЛИКЕ КРЫМ. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2019;11(4):91-97. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-91-97

For citation:


Laga V.Y., Nemykin A.V., Begma E.N., Strakhova A.M., Vasilyeva N.A., Ozhmegova E.N., Antonova A.A., Bobkova M.R. MOLECULAR GENETIC ANALYSIS OF HIV-1 VARIANTS CIRCULATING IN THE REPUBLIC OF CRIMEA. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. 2019;11(4):91-97. (In Russ.) https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-91-97

Просмотров: 67


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2077-9828 (Print)